RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm13119B1ARV5 481 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Angpt2O35608 496 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AprtP08030 180 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tap1P21958 724 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Stfa3P35173 103 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Aldh2P47738 519 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gp1bbP56400 206 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdh6P97326 790 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 UcmaQ14BU0 138 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hephl1Q3V1H3 1159 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kmt5cQ6Q783 468 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem169Q8BG50 297 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ldhal6bQ8BVP2 382 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lurap1lQ8K2P1 221 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trim31Q8R0K2 507 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nle1Q8VEJ4 485 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ptbp2Q91Z31 531 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cmc1Q9CPZ8 106 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 4930558K02RikE0CXC6 182 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Polr2jO08740 117 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Spp1P10923 294 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SgcdP82347 289 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cntn4Q69Z26 1026 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dpy19l3Q71B07 716 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1046Q7TR79 316 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Imp4Q8VHZ7 291 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gria3Q9Z2W9 888 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp4a29A0A087WPC3 509 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lcn6A2AJB9 181 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 EXOC1LB9EK06 172 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Limk2O54785 638 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pole2O54956 527 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 JunP05627 334 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GuloP58710 440 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rps24P62849 133 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hrh1P70174 488 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 BcheQ03311 603 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpr19Q61121 415 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc6a3Q61327 619 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prickle2Q80Y24 845 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Csnk1g1Q8BTH8 459 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 LzicQ8K3C3 190 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mrpl1Q99N96 336 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Spcs2Q9CYN2 226 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hmg20aQ9DC33 346 aa15.88■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pnldc1B2RXZ1 531 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Obox5G3X9P6 291 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pax7P47239 503 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Btg3P50615 252 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dpf3P58269 378 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vbp1P61759 196 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NficP70255 439 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Colec11Q3SXB8 272 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Brms1lQ3U1T3 323 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Psapl1Q8C1C1 522 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fem1cQ8CEF1 617 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 WwoxQ91WL8 414 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slco1a4Q9EP96 670 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r125D3Z3M1 369 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trim30bE9PVL6 203 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm21738J3QP72 227 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sdc4O35988 198 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 DbtP53395 482 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dmrtc1bQ2PMX6 267 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc6a4Q60857 630 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vac14Q80WQ2 782 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Chst2Q80WV3 530 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Plekhn1Q8C886 359 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mtmr14Q8VEL2 648 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Acer3Q9D099 267 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Efhd2Q9D8Y0 240 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SqorQ9R112 450 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pkd2l1A2A259 760 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Itga8A2ARA8 1062 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem245B1AZA5 876 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn1r238E9Q373 306 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp788E9Q980 884 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prkag1O54950 330 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ldb2O55203 373 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gabrr2P56476 465 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tuba1cP68373 449 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Echdc2Q3TLP5 296 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nr1d2Q60674 576 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Igfbp7Q61581 281 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Magee1Q6PCZ4 918 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 RorbQ8R1B8 470 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AdprmQ99KS6 340 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dhrs4Q99LB2 279 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q99LU8 229 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kbtbd12Q9D618 625 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tuba8Q9JJZ2 449 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 HaspinQ9Z0R0 754 aa15.87■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp236S4R299 1847 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pate1E9Q658 125 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r2L7N2E9 908 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdk2ap1O35207 114 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SykP48025 629 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GaaP70699 953 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SobpQ0P5V2 864 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr616Q3KPB0 317 aa15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.9 ms