RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622166.1

IGHV3-54-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-54 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHV3-54, Length 353 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-54-201ENST00000622166 BAIAP3O94812 1187 aa9.49□□□□□ -0.89
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IGHV3-54-201ENST00000622166 GPR141Q7Z602 305 aa9.49□□□□□ -0.89
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IGHV3-54-201ENST00000622166 OR8J3Q8NGG0 315 aa9.49□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa9.49□□□□□ -0.89
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IGHV3-54-201ENST00000622166 LZICQ8WZA0 190 aa9.49□□□□□ -0.89
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IGHV3-54-201ENST00000622166 NSMCE2Q96MF7 247 aa9.49□□□□□ -0.89
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IGHV3-54-201ENST00000622166 SMIM14Q96QK8 99 aa9.49□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 ACOX2Q99424 681 aa9.49□□□□□ -0.89
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IGHV3-54-201ENST00000622166 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
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IGHV3-54-201ENST00000622166 AP3M1Q9Y2T2 418 aa9.49□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 ASB1Q9Y576 335 aa9.49□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 BACE2Q9Y5Z0 518 aa9.49□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa9.49□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 TRIM64BA6NI03 449 aa9.48□□□□□ -0.89
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IGHV3-54-201ENST00000622166 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 E5RI56 91 aa9.48□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 CBX4O00257 560 aa9.48□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 EI24O14681 340 aa9.48□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 LSM1O15116 133 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 RAD51BO15315 384 aa9.48□□□□□ -0.89
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IGHV3-54-201ENST00000622166 TPST1O60507 370 aa9.48□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 OTCP00480 354 aa9.48□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 HPRP00739 348 aa9.48□□□□□ -0.89
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IGHV3-54-201ENST00000622166 CAPN1P07384 714 aa9.48□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 GALTP07902 379 aa9.48□□□□□ -0.89
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IGHV3-54-201ENST00000622166 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 GGT1P19440 569 aa9.48□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 JAK1P23458 1154 aa9.48□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 VARSP26640 1264 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 HTR6P50406 440 aa9.48□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 GATMP50440 423 aa9.48□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 EMP3P54852 163 aa9.48□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 TRAF3Q13114 568 aa9.48□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 GTF2H2Q13888 395 aa9.48□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 FUT11Q495W5 492 aa9.48□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 TIGD2Q4W5G0 525 aa9.48□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 CYBRD1Q53TN4 286 aa9.48□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 FBXO48Q5FWF7 155 aa9.48□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa9.48□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 ADGRF1Q5T601 910 aa9.48□□□□□ -0.89
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