RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 IQCDQ96DY2 449 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 FCRL4Q96PJ5 515 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 GNLYP22749 145 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 CHAF1BQ13112 559 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 IL10RAQ13651 578 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 LAMB3Q13751 1172 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 TEX44Q53QW1 395 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 AMZ2Q86W34 360 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 VSIG1Q86XK7 387 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC30BQ8N4P2 665 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 BRSK1Q8TDC3 778 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC25Q96NG3 672 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 FGF21Q9NSA1 209 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 TTLL8A6PVC2 850 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 UGT1A9O60656 530 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNJ13O60928 360 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 VPS4BO75351 444 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 POP7O75817 140 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT1P04264 644 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 UGT1A6P19224 532 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 UGT1A1P22309 533 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 UGT1A4P22310 534 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 PTPN3P26045 913 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 PTPN4P29074 926 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 DYNLT1P63172 113 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 ACY1Q03154 408 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 NFE2L1Q14494 772 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 PLCL1Q15111 1095 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC18A3Q16572 532 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 C4orf17Q53FE4 359 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 RFX6Q8HWS3 928 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 TEKT5Q96M29 485 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR87Q9BY21 358 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 UGT1A7Q9HAW7 530 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 UGT1A10Q9HAW8 530 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 UGT1A8Q9HAW9 530 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 VPS4AQ9UN37 437 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM253P0C7T8 217 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 CD68P34810 354 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 CHRNA4P43681 627 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 CHRNA6Q15825 494 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 NADK2Q4G0N4 442 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHL35Q6PF15 583 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 KDELC1Q6UW63 502 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM151BQ6UXP7 276 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 CPT1CQ8TCG5 803 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 THAP4Q8WY91 577 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 SEC14L1Q92503 715 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5K3A6NET4 321 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 TLCD2A6NGC4 264 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2AG2A6NM03 316 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 SPAM1P38567 509 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 WNT3AP56704 352 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 TPM4P67936 248 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 SIRPB2Q5JXA9 342 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 SYVN1Q86TM6 617 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 KMT5CQ86Y97 462 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 D2HGDHQ8N465 521 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 DDHD1Q8NEL9 900 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC35G2Q8TBE7 412 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 DTX3LQ8TDB6 740 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 CD180Q99467 661 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 TRABDQ9H4I3 376 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 IL17CQ9P0M4 197 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 ARGFXA6NJG6 315 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 ARL4DP49703 201 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 PGDP52209 483 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS15P62841 145 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 HSD11B2P80365 405 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR19Q15760 415 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP2R5EQ16537 467 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM220Q6QAJ8 160 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A41Q8N5S1 370 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 EFCAB3Q8N7B9 438 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 GALNT11Q8NCW6 608 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A23Q9BV35 468 aa25.05■■□□□ 1.6
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