RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF547Q8IVP9 402 aa15.52■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 OR13J1Q8NGT2 312 aa15.52■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 CPT1BQ92523 772 aa15.52■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 HDAC10Q969S8 669 aa15.52■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 NAT9Q9BTE0 207 aa15.52■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 KIFC1Q9BW19 673 aa15.52■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 CATSPERZQ9NTU4 200 aa15.52■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 CPNE7Q9UBL6 633 aa15.52■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 SOX13Q9UN79 622 aa15.52■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 ST14Q9Y5Y6 855 aa15.52■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 CHD8Q9HCK8 2581 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 CCDC162PA2VCL2 907 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 LILRA5A6NI73 299 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC35G4P0C7Q5 338 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 CCKBRP32239 447 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 FOXN2P32314 431 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 GRIA1P42261 906 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 INHBCP55103 352 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 CCL7P80098 99 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 RPA4Q13156 261 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP15.51■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 RTP5Q14D33 572 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 METRNLQ641Q3 311 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 DET1Q7L5Y6 550 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 MAATS1Q7Z4T9 603 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 LRRC6Q86X45 466 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 LMNTD2Q8IXW0 634 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 BBOF1Q8ND07 529 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 ZFPM2Q8WW38 1151 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 SGF29Q96ES7 293 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 PRDM8Q9NQV8 689 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 NEU2Q9Y3R4 380 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 AK5Q9Y6K8 562 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 TPRP12270 2363 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 CCDC187A0A096LP49 1063 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM149AA5PLN7 773 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 TRABD2BA6NFA1 517 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 PRR19A6NJB7 356 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 GPR39O43194 453 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 KDM1AO60341 852 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 GOT2P00505 430 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 MGAT1P26572 445 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 CTSCP53634 463 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 B4GALNT1Q00973 533 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 KLHL7Q8IXQ5 586 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 OTUD6BQ8N6M0 293 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 TCF12Q99081 682 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM96AQ9H5X1 160 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 CHRAC1Q9NRG0 131 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC23A2Q9UGH3 650 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 CCDC78A2IDD5 438 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 KPNA5O15131 536 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 PPM1DO15297 605 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 POLBP06746 335 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 LSSP48449 732 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 CD151P48509 253 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 CAMK2BQ13554 666 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 MORF4L2Q15014 288 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 DBN1Q16643 649 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 IGF2-ASQ6U949 168 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 SYT10Q6XYQ8 523 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 PLXDC1Q8IUK5 500 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 NAT8LQ8N9F0 302 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 OR4D9Q8NGE8 314 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 CALML6Q8TD86 181 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 PATE1Q8WXA2 126 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 SERPINB12Q96P63 405 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 PANX3Q96QZ0 392 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 CMKLR1Q99788 373 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 TREX1Q9NSU2 369 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 SYBUQ9NX95 663 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 RABGEF1Q9UJ41 708 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 A0A1W2PQM1 296 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 H3BMM5 538 aa15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms