RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556321.1

PSMA3-210, Transcript of proteasome subunit alpha 3, human

TSL 2

Gene PSMA3, Length 500 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA3-210	ENST00000556321	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	LIPT1	Q9Y234	373 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	CEP350	Q5VT06	3117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	GH2	P01242	217 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	CYC1	P08574	325 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	LINGO3	P0C6S8	592 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	CBSL	P0DN79	551 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	VPREB1	P12018	145 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	ACHE	P22303	614 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	NR2F2	P24468	414 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	CBS	P35520	551 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	BMX	P51813	675 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	CDH12	P55289	794 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	C1QTNF8	P60827	252 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	TUBB4B	P68371	445 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	LAMB3	Q13751	1172 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	MEP1B	Q16820	701 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	SPATS1	Q496A3	300 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	TEX38	Q6PEX7	206 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	ADCK2	Q7Z695	626 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	SPRED1	Q7Z699	444 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	GALNT16	Q8N428	558 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	CCDC114	Q96M63	670 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	PRRX2	Q99811	253 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	THSD1	Q9NS62	852 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321		A4D1N5	150 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	CGB1	A6NKQ9	187 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	ENO4	A6NNW6	628 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	DNM1L	O00429	736 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	WNT9B	O14905	357 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	C1QL1	O75973	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	GJA1	P17302	382 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	AVPR1A	P37288	418 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	CAPZA1	P52907	286 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	CDH13	P55290	713 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	ST3GAL1	Q11201	340 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	GRIK2	Q13002	908 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	PTK6	Q13882	451 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	NFE2L1	Q14494	772 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	MYLK3	Q32MK0	819 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	DEF8	Q6ZN54	512 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	RAPH1	Q70E73	1250 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	GPSM1	Q86YR5	675 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	ARL10	Q8N8L6	244 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	SNX21	Q969T3	373 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	ERGIC1	Q969X5	290 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	EGFL8	Q99944	293 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	SH3GL2	Q99962	352 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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