RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525809.5

BBS1-208, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5

Gene BBS1, Length 601 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-208	ENST00000525809	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	SH3BP2	P78314	561 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	TLE1	Q04724	770 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	XRCC4	Q13426	336 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	ITGA9	Q13797	1035 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	GPR18	Q14330	331 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	LLGL1	Q15334	1064 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	SLC1A5	Q15758	541 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	RPE65	Q16518	533 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	ZNF567	Q8N184	647 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	IPMK	Q8NFU5	416 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	RSC1A1	Q92681	617 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	PDE7B	Q9NP56	450 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	CROT	Q9UKG9	612 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	RARRES3	Q9UL19	164 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	LRP4	O75096	1905 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	SPTA1	P02549	2419 aa		10.11	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	PIPSL	A2A3N6	862 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	KLHL33	A6NCF5	533 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	C2orf81	A6NN90	581 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	ANXA9	O76027	345 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	MSH3	P20585	1137 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	FECH	P22830	423 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	CASR	P41180	1078 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	CHRNA4	P43681	627 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	ARL4D	P49703	201 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	CTSC	P53634	463 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	GEM	P55040	296 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	ACY1	Q03154	408 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	NOMO1	Q15155	1222 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	METRNL	Q641Q3	311 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	KMT5C	Q86Y97	462 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	CD180	Q99467	661 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	TSPY26P	Q9H489	355 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	POLH	Q9Y253	713 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	C5orf60	A6NFR6	353 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	MGAT4D	A6NG13	374 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	C21orf140	B9A014	251 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809		H7C0C1	242 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	CREG1	O75629	220 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	AGT	P01019	485 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	PYGM	P11217	842 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	ATP5O	P48047	213 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	ADCY2	Q08462	1091 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	ERV3-1	Q14264	604 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	PRPSAP1	Q14558	356 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	PLCL1	Q15111	1095 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	SPA17	Q15506	151 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	COLEC12	Q5KU26	742 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	CCDC181	Q5TID7	509 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	BBS12	Q6ZW61	710 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	SEC14L1	Q92503	715 aa		10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
BBS1-208	ENST00000525809	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		10.09	□□□□□ -0.79

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