RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518916.5

MSC-AS1-204, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 864 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-204ENST00000518916 MDM1Q8TC05 714 aa14.54□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 RLN3Q8WXF3 142 aa14.54□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 SNX19Q92543 992 aa14.54□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 SGF29Q96ES7 293 aa14.54□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 COX14Q96I36 57 aa14.54□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 NMRAL1Q9HBL8 299 aa14.54□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 SLC17A7Q9P2U7 560 aa14.54□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 OR1A2Q9Y585 309 aa14.54□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 NUMA1Q14980 2115 aa14.54□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 FANCMQ8IYD8 2048 aa14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 K7ESF4 209 aa14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 LAMTOR5O43504 91 aa14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 DNAJC6O75061 913 aa14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 CBSLP0DN79 551 aa14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 KELP23276 732 aa14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 DGKAP23743 735 aa14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 CBSP35520 551 aa14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 TRIM23P36406 574 aa14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 CLCN7P51798 805 aa14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 PGGT1BP53609 377 aa14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 KIAA1024LP59773 190 aa14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 ATP6V0D1P61421 351 aa14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 TMEM220Q6QAJ8 160 aa14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 CPNE9Q8IYJ1 553 aa14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 MYO1HQ8N1T3 1032 aa14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 ARMC2Q8NEN0 867 aa14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 ELMO1Q92556 727 aa14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 FOXJ1Q92949 421 aa14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 NXNL1Q96CM4 212 aa14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 LINGO1Q96FE5 620 aa14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 APOOQ9BUR5 198 aa14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 DERL2Q9GZP9 239 aa14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 MLXIPLQ9NP71 852 aa14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 ATXN10Q9UBB4 475 aa14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 MED16Q9Y2X0 877 aa14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa14.53□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 BPTFQ12830 3046 aa14.52□□□□□ -0.08
MSC-AS1-204ENST00000518916 A6NNZ2 444 aa14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 MEI4A8MW99 385 aa14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 TOR1BO14657 336 aa14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 MAP3K13O43283 966 aa14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 PLIN3O60664 434 aa14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 PROCP04070 461 aa14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 IGHV4-34P06331 123 aa14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 RBP1P09455 135 aa14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 NEFHP12036 1026 aa14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 HTR1BP28222 390 aa14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 HOXA6P31267 233 aa14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 GMPRP36959 345 aa14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 MDH1P40925 334 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 NBL1P41271 181 aa14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 GLRBP48167 497 aa14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 CTSCP53634 463 aa14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 GYS2P54840 703 aa14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 IRX4P78413 519 aa14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 MPP2Q14168 576 aa14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 TUBB8Q3ZCM7 444 aa14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 CRTC3Q6UUV7 619 aa14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 CADM4Q8NFZ8 388 aa14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 GIMAP7Q8NHV1 300 aa14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 RDH11Q8TC12 318 aa14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 NAT14Q8WUY8 206 aa14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 UBXN10Q96LJ8 280 aa14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 CCM2Q9BSQ5 444 aa14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 LATS2Q9NRM7 1088 aa14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 IGSF5Q9NSI5 407 aa14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 TMEM216Q9P0N5 145 aa14.52□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa14.51□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa14.51□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 CCDC189A1A4V9 331 aa14.51□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 TFEBP19484 476 aa14.51□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 TAC1P20366 129 aa14.51□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 AOAHP28039 575 aa14.51□□□□□ -0.09
MSC-AS1-204ENST00000518916 RABIFP47224 123 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms