RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514110.5

SNHG4-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 4, human

TSL 1 (best)

Gene SNHG4, Length 679 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG4-208	ENST00000514110	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	P3H4	Q92791	437 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	TTC25	Q96NG3	672 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	FCRL5	Q96RD9	977 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	SPTA1	P02549	2419 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	OR2AG2	A6NM03	316 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	KCNJ13	O60928	360 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	TIAF1	O95411	115 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	FGF5	P12034	268 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	FECH	P22830	423 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	CASR	P41180	1078 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	MARCKSL1	P49006	195 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	ERV3-1	Q14264	604 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	NFE2L1	Q14494	772 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	PTPRCAP	Q14761	206 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	IGFBP7	Q16270	282 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	RPE65	Q16518	533 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	PPP2R5E	Q16537	467 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	COLEC12	Q5KU26	742 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	PID1	Q7Z2X4	250 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	IPMK	Q8NFU5	416 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	RAB33B	Q9H082	229 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	TFR2	Q9UP52	801 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	ALG6	Q9Y672	507 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNHG4-208	ENST00000514110	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		11.96	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110		K7EM74	188 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	MTSS1	O43312	755 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	KATNA1	O75449	491 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	11.95	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	FOLR1	P15328	257 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	HLA-DPA1	P20036	260 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	MPP3	Q13368	585 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	KCNAB1	Q14722	419 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	11.95	□□□□□ -0.5	1e-53	■■■■□ 19.5
SNHG4-208	ENST00000514110	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	TMEM135	Q86UB9	458 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	NAT14	Q8WUY8	206 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	VAT1	Q99536	393 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	SMOX	Q9NWM0	555 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	11.95	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	HACD3	Q9P035	362 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	PKP3	Q9Y446	797 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	KCTD3	Q9Y597	815 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	ARL5A	Q9Y689	179 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	HACD1	B0YJ81	288 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	AGT	P01019	485 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	EBLN1	P0CF75	366 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	NR1D1	P20393	614 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	MSH3	P20585	1137 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	MAGEA1	P43355	309 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	FOXK1	P85037	733 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	TUBB3	Q13509	450 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	OLIG2	Q13516	323 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	ITGA9	Q13797	1035 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	SEPT6	Q14141	434 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	PLCL1	Q15111	1095 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SNHG4-208	ENST00000514110	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5

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