RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509784.1

CALCOCO2-216, Transcript of calcium binding and coiled-coil domain 2, human

TSL 4

Gene CALCOCO2, Length 578 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALCOCO2-216	ENST00000509784	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SKIL	P12757	684 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ACTN1	P12814	892 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HOXB2	P14652	356 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HIST1H2AD	P20671	130 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	IL11	P20809	199 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ACADL	P28330	430 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	STX2	P32856	288 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LMAN1	P49257	510 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SUOX	P51687	545 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	STAT2	P52630	851 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NUDT6	P53370	316 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GPS2	Q13227	327 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NECTIN1	Q15223	517 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RASA2	Q15283	850 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PTPN14	Q15678	1187 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DLG2	Q15700	870 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	EFNB3	Q15768	340 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CAMK4	Q16566	473 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	AACS	Q86V21	672 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HACE1	Q8IYU2	909 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TMTC2	Q8N394	836 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NECAB1	Q8N987	351 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	IQUB	Q8NA54	791 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KCTD6	Q8NC69	237 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RND1	Q92730	232 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MOAP1	Q96BY2	351 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TXNDC15	Q96J42	360 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	EGLN2	Q96KS0	407 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LRFN5	Q96NI6	719 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GCNA	Q96QF7	691 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ABHD1	Q96SE0	405 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KXD1	Q9BQD3	176 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HAUS8	Q9BT25	410 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	APOL6	Q9BWW8	343 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PADI1	Q9ULC6	663 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FZD10	Q9ULW2	581 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	C4A	P0C0L4	1744 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	C4B	P0C0L5	1744 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LTN1	O94822	1766 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SPEF2	Q9C093	1822 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	C5	P01031	1676 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KIF1A	Q12756	1690 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SLIT3	O75094	1523 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NFAT5	O94916	1531 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	OR6C75	A6NL08	312 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	VGLL3	A8MV65	326 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784		B4DGG1	531 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	INAFM1	C9JVW0	142 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HIP1	O00291	1037 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	WNT9B	O14905	357 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ADAMDEC1	O15204	470 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MOSPD3	O75425	235 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DAB1	O75553	588 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SOX30	O94993	753 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ICAM1	P05362	532 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HOXB7	P09629	217 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MMP9	P14780	707 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PSMA5	P28066	241 aa		3.14	□□□□□ -1.91

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