RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508652.5

TMA16-205, Transcript of translation machinery associated 16 homolog, human

TSL 2

Gene TMA16, Length 1,195 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMA16-205	ENST00000508652	COL6A2	P12110	1019 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	CD38	P28907	300 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	CCT5	P48643	541 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	CLCN7	P51798	805 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	PLK5	Q496M5	336 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	PIM3	Q86V86	326 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	ZBTB2	Q8N680	514 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	ELMO1	Q92556	727 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	SKA1	Q96BD8	255 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	GALP	Q9UBC7	116 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	MED16	Q9Y2X0	877 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	PLXNA2	O75051	1894 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	VCAN	P13611	3396 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	KLHL33	A6NCF5	533 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	TLR4	O00206	839 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	COPE	O14579	308 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	DNAJC6	O75061	913 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	APOA4	P06727	396 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	BRAF	P15056	766 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	DGKA	P23743	735 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	AOAH	P28039	575 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	CCR7	P32248	378 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	SLC26A3	P40879	764 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	CCNF	P41002	786 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	RGS4	P49798	205 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	CSRP3	P50461	194 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	PGGT1B	P53609	377 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	IL2	P60568	153 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	ZNF460	Q14592	562 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	PMS2CL	Q68D20	193 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	LCA5	Q86VQ0	697 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	AMZ2	Q86W34	360 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	BANP	Q8N9N5	519 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	CD200R1	Q8TD46	325 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	KL	Q9UEF7	1012 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	SUFU	Q9UMX1	484 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652		A0A1W2PR77	199 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	PRSS38	A1L453	326 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	MGAT4D	A6NG13	374 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	KCNJ13	O60928	360 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	LILRB5	O75023	590 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	SPAG7	O75391	227 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	TNF	P01375	233 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	FUCA1	P04066	466 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	GSTA1	P08263	222 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	CCDC166	P0CW27	439 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	CBSL	P0DN79	551 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	GNS	P15586	552 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	VCL	P18206	1134 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	ITPKA	P23677	461 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	CRHR1	P34998	444 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	CBS	P35520	551 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	GNPDA1	P46926	289 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TMA16-205	ENST00000508652	TEAD4	Q15561	434 aa		13.96	□□□□□ -0.17

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