RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 MSH3P20585 1137 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 CAPN3P20807 821 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 MAGP20916 626 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 GNPDA1P46926 289 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 ALDH9A1P49189 494 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 SPDYE7PQ495Y7 208 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM91A1Q658Y4 838 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 TXNDC11Q6PKC3 985 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 C17orf99Q6UX52 265 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 LIX1Q8N485 282 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 ROPN1LQ96C74 230 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 MAGED4Q96JG8 741 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 SPO11Q9Y5K1 396 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 CLDN7O95471 211 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 RPIAP49247 311 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC11A1P49279 550 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 CDH4P55283 916 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 XKR5Q6UX68 686 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 GPR180Q86V85 440 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 RBFAQ8N0V3 343 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 GIPC3Q8TF64 312 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 LRTM1Q9HBL6 345 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 GNPTGQ9UJJ9 305 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 VPS4AQ9UN37 437 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 CPQQ9Y646 472 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 DOCK3Q8IZD9 2030 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 K7ERQ8 282 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 SOCS2O14508 198 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 FFAR2O15552 330 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 KDM1AO60341 852 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 KERAO60938 352 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 C1QAP02745 245 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 HTR7P34969 479 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 IST1P53990 364 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 ST8SIA6P61647 398 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 CYP4F2P78329 520 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 CYP4F3Q08477 520 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 MORN1Q5T089 497 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 DENND5AQ6IQ26 1287 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 CYP20A1Q6UW02 462 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 KCTD8Q6ZWB6 473 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 PHACTR4Q8IZ21 702 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 AHI1Q8N157 1196 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 OR4F6Q8NGB9 312 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 OR13J1Q8NGT2 312 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 RORBQ92753 470 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM159Q96B96 161 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 FANCEQ9HB96 536 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 AMBNQ9NP70 447 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM248Q9NWD8 314 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 CFAP97Q9P2B7 532 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 ATXN10Q9UBB4 475 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 SHROOM3Q8TF72 1996 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 NME4O00746 187 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 HOXA2O43364 376 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 STK16O75716 305 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 GSRP00390 522 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 OR56A5P0C7T3 313 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 HNF4AP41235 474 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 MAPKAPK2P49137 400 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 APLP1P51693 650 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 TGFBIQ15582 683 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 OGFOD2Q6N063 350 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 SPATA19Q7Z5L4 167 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 PREBQ9HCU5 417 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 PTTG2Q9NZH5 202 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 FOCADQ5VW36 1801 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM20BO75063 409 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 SNAP29O95721 258 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 DPP6P42658 865 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF284Q2VY69 593 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 SYVN1Q86TM6 617 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 HSPBAP1Q96EW2 488 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 GSTO2Q9H4Y5 243 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 PCDH10Q9P2E7 1040 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 URB1O60287 2271 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 C5orf58C9J3I9 102 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 hCG_2039718K7EN88 272 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 PRAMEF11O60813 436 aa12.62□□□□□ -0.39
RABGEF1-211ENST00000503687 INHAP05111 366 aa12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms