RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490813.5

CEP170-216, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CEP170, Length 1,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-216	ENST00000490813	PMPCB	O75439	489 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	SCRG1	O75711	98 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	PALM	O75781	387 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	SMC2	O95347	1197 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	MED26	O95402	600 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	ERBB2	P04626	1255 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	FOSL1	P15407	271 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	PFKFB1	P16118	471 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	SDC4	P31431	198 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	CAPZB	P47756	277 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	GFER	P55789	205 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	PPP2R2A	P63151	447 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	TUBB4B	P68371	445 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	RBPJ	Q06330	500 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	PAK1	Q13153	545 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	IL10RA	Q13651	578 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	LAMB3	Q13751	1172 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	TUBB2A	Q13885	445 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	SSPN	Q14714	243 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	PLCL1	Q15111	1095 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	CNGA3	Q16281	694 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	DOK6	Q6PKX4	331 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	MMP21	Q8N119	569 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	GALNT16	Q8N428	558 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	SHC3	Q92529	594 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	AP2M1	Q96CW1	435 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	SCRN2	Q96FV2	425 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	EXOC2	Q96KP1	924 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	HPSE	Q9Y251	543 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	CACNA1C	Q13936	2221 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CEP170-216	ENST00000490813	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813		A0A1B0GVL5	298 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	BICDL2	A1A5D9	508 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813		F5H423	210 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	KCNJ13	O60928	360 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	JRK	O75564	520 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	MTA2	O94776	668 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	CP	P00450	1065 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	CALCA	P01258	141 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	MYBL2	P10244	700 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	TYRP1	P17643	537 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	GM2A	P17900	193 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	VCL	P18206	1134 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	AGXT	P21549	392 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	FLT3	P36888	993 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	ETV3	P41162	512 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	PRCP	P42785	496 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	PTPN9	P43378	593 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	POLD2	P49005	469 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	SCNN1B	P51168	640 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	HSD11B2	P80365	405 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	ATP11A	P98196	1134 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	CDC16	Q13042	620 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	INA	Q16352	499 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	C8orf34	Q49A92	452 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	DCAF10	Q5QP82	559 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	DENND2C	Q68D51	928 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	IRGC	Q6NXR0	463 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813		Q6ZVL8	140 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CEP170-216	ENST00000490813	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		5.52	□□□□□ -1.53

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