RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC4A1P02730 911 aa9.25□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 PIRTP0C851 137 aa9.25□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM228BP0C875 321 aa9.25□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 PER3P56645 1201 aa9.25□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 TAS2R40P59535 323 aa9.25□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 DCDC1P59894 354 aa9.25□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 ZBTB17Q13105 803 aa9.25□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 NR1I3Q14994 352 aa9.25□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 PDK2Q15119 407 aa9.25□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 INSCQ1MX18 579 aa9.25□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 FIGNQ5HY92 759 aa9.25□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa9.25□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 TRIM48Q8IWZ4 208 aa9.25□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 CCNYQ8ND76 341 aa9.25□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 GPR26Q8NDV2 337 aa9.25□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 THAP4Q8WY91 577 aa9.25□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 RSC1A1Q92681 617 aa9.25□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 GLYATL1Q969I3 302 aa9.25□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 HDAC11Q96DB2 347 aa9.25□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 TRIB3Q96RU7 358 aa9.25□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa9.25□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 ADGRE3Q9BY15 652 aa9.25□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa9.25□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 TRIM39Q9HCM9 518 aa9.25□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 LHX9Q9NQ69 397 aa9.25□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 SHOC2Q9UQ13 582 aa9.25□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 OSGIN2Q9Y236 505 aa9.25□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa9.25□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A1W2PQJ5 194 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 OR52A4PA6NMU1 304 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 GPR89AB7ZAQ6 455 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF185O15231 689 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 MTX2O75431 263 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 TIAF1O95411 115 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 NADKO95544 446 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 RECKO95980 971 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 MBD3O95983 291 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 SERPING1P05155 500 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 CCNYL3P0C7X3 344 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 GPR89BP0CG08 455 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 BRAFP15056 766 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 AMD1P17707 334 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 PTGER4P35408 488 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 CAPZBP47756 277 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP10-9P60411 292 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 IL11RAQ14626 422 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM69BQ5VUD6 431 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 PDPK2PQ6A1A2 396 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 PRSS42Q7Z5A4 293 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 LRRTM4Q86VH4 590 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF547Q8IVP9 402 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 MAP7D3Q8IWC1 876 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 TRAM1L1Q8N609 369 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 KLHL6Q8WZ60 621 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 RAPGEF5Q92565 580 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 INPP5DQ92835 1189 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 TIMM29Q9BSF4 260 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 CEP41Q9BYV8 373 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 TRIM8Q9BZR9 551 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC40A1Q9NP59 571 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM63CQ9P1W3 806 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 COPG2Q9UBF2 871 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 PADI1Q9ULC6 663 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 SVILO95425 2214 aa9.24□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa9.23□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 C21orf140B9A014 251 aa9.23□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 GOLGA6L22H0YM25 854 aa9.23□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 KMOO15229 486 aa9.23□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 VEGFDO43915 354 aa9.23□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 SPAG6O75602 509 aa9.23□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 SERPINC1P01008 464 aa9.23□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 FGF5P12034 268 aa9.23□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 BPIP17213 487 aa9.23□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 NELFEP18615 380 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 ITGA3P26006 1051 aa9.23□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 RPL10P27635 214 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 PTPN4P29074 926 aa9.23□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 PBX1P40424 430 aa9.23□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 DRG2P55039 364 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 PPP1CAP62136 330 aa9.23□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 ZBED6P86452 979 aa9.23□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 LAMB3Q13751 1172 aa9.23□□□□□ -0.93
SMARCE1-210ENST00000481231 GPR18Q14330 331 aa9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.1 ms