RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479541.1

RNF216-208, Transcript of ring finger protein 216, human

TSL 4

Gene RNF216, Length 580 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF216-208	ENST00000479541	DSC1	Q08554	894 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	TRAF2	Q12933	501 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	DLG2	Q15700	870 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	SNAPC1	Q16533	368 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	CTF1	Q16619	201 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	HECTD3	Q5T447	861 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	AACS	Q86V21	672 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	VPS33A	Q96AX1	596 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	ZBTB9	Q96C00	473 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	ORAI1	Q96D31	301 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	PIK3R4	Q99570	1358 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	MBD5	Q9P267	1494 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	WDR90	Q96KV7	1748 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	TRPM2	O94759	1503 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	MAP3K5	Q99683	1374 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541		I6L893	689 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	SOCS2	O14508	198 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	PRAMEF11	O60813	436 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	PRLR	P16471	622 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	CPT2	P23786	658 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	RFX2	P48378	723 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	RAB28	P51157	221 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	PPP5C	P53041	499 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	PPAT	Q06203	517 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	TWIST1	Q15672	202 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	LETM2	Q2VYF4	491 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	CBWD6	Q4V339	395 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	PIP4P1	Q86T03	277 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	EMC1	Q8N766	993 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	TAAR8	Q969N4	342 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	HDAC11	Q96DB2	347 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	TXNDC15	Q96J42	360 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	SPAG5	Q96R06	1193 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	SEMA3C	Q99985	751 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	HAUS8	Q9BT25	410 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	MMP25	Q9NPA2	562 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	ZFYVE9	O95405	1425 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	TNS2	Q63HR2	1409 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	FMN1	Q68DA7	1419 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	TIMM23	O14925	209 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	KCNN4	O15554	427 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	NDUFS4	O43181	175 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	SERPINI2	O75830	405 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	PSMD10	O75832	226 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	GAGE7	O76087	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	CH25H	O95992	272 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	BCL10	O95999	233 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	GAGE12F	P0CL80	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	GAGE12G	P0CL81	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	GAGE12I	P0CL82	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	NR2F2	P24468	414 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	AMT	P48728	403 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	TERF1	P54274	439 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	GAGE1	Q13065	139 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	GAGE4	Q13068	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	DECR1	Q16698	335 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	MEP1A	Q16819	746 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	AMZ1	Q400G9	498 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	CCDC184	Q52MB2	194 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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