RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 ZBTB14O43829 449 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 CCDC22O60826 627 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 RHOBTB1O94844 696 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 UNC5CO95185 931 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 MLYCDO95822 493 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 ENO1P06733 434 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 VIMP08670 466 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 TFEBP19484 476 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 KCNA5P22460 613 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 CCR5P51681 352 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 TMPRSS15P98073 1019 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF460Q14592 562 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 TTLL9Q3SXZ7 439 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 SPATS1Q496A3 300 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 COQ5Q5HYK3 327 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 SULT1C3Q6IMI6 304 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 TRIM67Q6ZTA4 783 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 CLNKQ7Z7G1 428 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 PIM3Q86V86 326 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 PARP9Q8IXQ6 854 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 GPATCH11Q8N954 259 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 MGARPQ8TDB4 240 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 PBXIP1Q96AQ6 731 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 NUS1Q96E22 293 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 NDNQ99608 321 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 CLPBQ9H078 707 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 GPRC5BQ9NZH0 403 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 GULP1Q9UBP9 304 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 TRPS1Q9UHF7 1281 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 TRPC5OSA6NMA1 111 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 SMIM24O75264 130 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 WFS1O76024 890 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 PIRTP0C851 137 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 ACADLP28330 430 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 FMO4P31512 558 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 CCR7P32248 378 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 PIK3CGP48736 1102 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 LIG3P49916 1009 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 ARHGEF7Q14155 803 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 UNC5DQ6UXZ4 953 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 HACD2Q6Y1H2 254 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 KBTBD6Q86V97 674 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 TNS4Q8IZW8 715 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 TMEM79Q9BSE2 394 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 SLC29A3Q9BZD2 475 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 TRIM39Q9HCM9 518 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 MMP17Q9ULZ9 603 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 CCL27Q9Y4X3 112 aa6.35□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 TAPBPO15533 448 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 NIPSNAP2O75323 286 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 C6P13671 934 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 PMLP29590 882 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 HOXA6P31267 233 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 MAGEA9P43362 315 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 RGS4P49798 205 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 PTPRRQ15256 657 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 EOGTQ5NDL2 527 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 FAM151BQ6UXP7 276 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 WASH2PQ6VEQ5 465 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 GJD3Q8N144 294 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 NAT16Q8N8M0 369 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 L3MBTL4Q8NA19 623 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 OR2L2Q8NH16 312 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 SORCS1Q8WY21 1168 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 CLDN23Q96B33 292 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 RHBDF1Q96CC6 855 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 ZFYVE19Q96K21 471 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 TIMM29Q9BSF4 260 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 CCM2Q9BSQ5 444 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 BOCQ9BWV1 1114 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 SGK2Q9HBY8 427 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 WASH6PQ9NQA3 447 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 CLDND1Q9NY35 253 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 GTSE1Q9NYZ3 720 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 KLK4Q9Y5K2 254 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 CCL22O00626 93 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 ARFIP2P53365 341 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 NCALDP61601 193 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 LCP2Q13094 533 aa6.34□□□□□ -1.39
PRKCI-202ENST00000476635 CSHL1Q14406 222 aa6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms