RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472943.5

LINC00886-201, long intergenic non-protein coding RNA 886, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00886, Length 3,306 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00886-201ENST00000472943 LCHNA4D1U4 455 aa10.23□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 CASTOR2A6NHX0 329 aa10.23□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 RPP40O75818 363 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 CHEK2O96017 543 aa10.23□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 THP07101 528 aa10.23□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 ITIH1P19827 911 aa10.23□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 OCA2Q04671 838 aa10.23□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 TYSND1Q2T9J0 566 aa10.23□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 Q6ZSR9 355 aa10.23□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 FRA10AC1Q70Z53 315 aa10.23□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 LRRTM3Q86VH5 581 aa10.23□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF683Q8IZ20 524 aa10.23□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 GPC2Q8N158 579 aa10.23□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa10.23□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 OR4L1Q8NH43 312 aa10.23□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 ZFP90Q8TF47 636 aa10.23□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 SLC16A10Q8TF71 515 aa10.23□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 ERLEC1Q96DZ1 483 aa10.23□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 CGREF1Q99674 301 aa10.23□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 CORO1BQ9BR76 489 aa10.23□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 ACTL8Q9H568 366 aa10.23□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 NMUR1Q9HB89 426 aa10.23□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 ASB1Q9Y576 335 aa10.23□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 TOR1BO14657 336 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 STX16O14662 325 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 KLK8O60259 260 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 TBC1D4O60343 1298 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 OGNP20774 298 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 NFKBIAP25963 317 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 KCNAB2Q13303 367 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 RBBP7Q16576 425 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 AAK1Q2M2I8 961 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 PRR23BQ6ZRT6 265 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 VMP1Q96GC9 406 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF583Q96ND8 569 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 SLX1AQ9BQ83 275 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 ACBD6Q9BR61 282 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 HGH1Q9BTY7 390 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 SP110Q9HB58 689 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 SYTL2Q9HCH5 934 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 TMEM45AQ9NWC5 275 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 COMMD8Q9NX08 183 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 GALPQ9UBC7 116 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 SLC1A7O00341 560 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 RHOBTB1O94844 696 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 PIRTP0C851 137 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 ISL1P61371 349 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 LAPTM5Q13571 262 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 GALNT3Q14435 633 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 MFSD10Q14728 455 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 BCL2A1Q16548 175 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 ALFQ53S48 1182 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 MSANTD2Q6P1R3 559 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 SLCO6A1Q86UG4 719 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF555Q8NEP9 628 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 OR10T2Q8NGX3 314 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 PEX13Q92968 403 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 LPPQ93052 612 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 ESAMQ96AP7 390 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 C1orf74Q96LT6 269 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 CCDC138Q96M89 665 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 CCDC115Q96NT0 180 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 USE1Q9NZ43 259 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 DNAJB9Q9UBS3 223 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 GIT1Q9Y2X7 761 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 ARNTLO00327 626 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 DNAJB5O75953 348 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 OR4F21O95013 312 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 MLYCDO95822 493 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 CST1P01037 141 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 TGM1P22735 817 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 FMO4P31512 558 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 EPS8Q12929 822 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 UPP1Q16831 310 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 MFSD4AQ8N468 514 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 FBXO30Q8TB52 745 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 SDCCAG3Q96C92 435 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 NODALQ96S42 347 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 GORASP2Q9H8Y8 452 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 HEBP1Q9NRV9 189 aa10.22□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 SYCE1LA8MT33 242 aa10.21□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 BTN3A1O00481 513 aa10.21□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 E2F3O00716 465 aa10.21□□□□□ -0.77
LINC00886-201ENST00000472943 TNFRSF10BO14763 440 aa10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.8 ms