RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472189.1

NCOR1-215, Transcript of nuclear receptor corepressor 1, human

TSL 2

Gene NCOR1, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCOR1-215	ENST00000472189	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	SCFD2	Q8WU76	684 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	WBP1	Q96G27	269 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	TTC14	Q96N46	770 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	EDEM2	Q9BV94	578 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	KRT84	Q9NSB2	600 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	KLK13	Q9UKR3	277 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	HSF4	Q9ULV5	492 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189		A0A0A0MQY5	61 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189		A0A1W2PRG0	241 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	KLK10	O43240	276 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	MLYCD	O95822	493 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	CBSL	P0DN79	551 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	TDGF1	P13385	188 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	PPP2R1A	P30153	589 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	CBS	P35520	551 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	CLCNKB	P51801	687 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	GPR68	Q15743	365 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	LETM2	Q2VYF4	491 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	SYTL3	Q4VX76	610 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	ARMC3	Q5W041	872 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	SERINC5	Q86VE9	423 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	LONP2	Q86WA8	852 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	SETD9	Q8NE22	299 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	INPP5D	Q92835	1189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	CDH22	Q9UJ99	828 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	VPS28	Q9UK41	221 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	NRCAM	Q92823	1304 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	PEX12	O00623	359 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	CBX6	O95503	412 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	WEE2	P0C1S8	567 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	MYZAP	P0CAP1	466 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	KRT20	P35900	424 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	PGM1	P36871	562 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	P2RX3	P56373	397 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	CUL4A	Q13619	759 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	PELI3	Q8N2H9	469 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	BICD2	Q8TD16	824 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	APOPT1	Q96IL0	206 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	ISCU	Q9H1K1	167 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	RAI14	Q9P0K7	980 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	LAMA1	P25391	3075 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	MYH8	P13535	1937 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	CACNA1E	Q15878	2313 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NCOR1-215	ENST00000472189	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63

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