RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 ST14Q9Y5Y6 855 aa20.22■□□□□ 0.83
IMP4-209ENST00000462357 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa20.22■□□□□ 0.83
IMP4-209ENST00000462357 AK5Q9Y6K8 562 aa20.22■□□□□ 0.83
IMP4-209ENST00000462357 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa20.21■□□□□ 0.83
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IMP4-209ENST00000462357 GPR39O43194 453 aa20.21■□□□□ 0.83
IMP4-209ENST00000462357 DUX1O43812 170 aa20.21■□□□□ 0.83
IMP4-209ENST00000462357 SLC35G4P0C7Q5 338 aa20.21■□□□□ 0.83
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IMP4-209ENST00000462357 METRNLQ641Q3 311 aa20.21■□□□□ 0.83
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IMP4-209ENST00000462357 TUBB2BQ9BVA1 445 aa20.21■□□□□ 0.83
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IMP4-209ENST00000462357 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
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IMP4-209ENST00000462357 A6NCN8 305 aa20.19■□□□□ 0.82
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IMP4-209ENST00000462357 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
IMP4-209ENST00000462357 SPATA4Q8NEY3 305 aa20.19■□□□□ 0.82
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IMP4-209ENST00000462357 PATE1Q8WXA2 126 aa20.19■□□□□ 0.82
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IMP4-209ENST00000462357 TREX1Q9NSU2 369 aa20.19■□□□□ 0.82
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IMP4-209ENST00000462357 FAM187AA6NFU0 413 aa20.18■□□□□ 0.82
IMP4-209ENST00000462357 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
IMP4-209ENST00000462357 B4GAT1O43505 415 aa20.18■□□□□ 0.82
IMP4-209ENST00000462357 VAPBO95292 243 aa20.18■□□□□ 0.82
IMP4-209ENST00000462357 TTC4O95801 387 aa20.18■□□□□ 0.82
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IMP4-209ENST00000462357 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
IMP4-209ENST00000462357 DRG2P55039 364 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
IMP4-209ENST00000462357 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
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IMP4-209ENST00000462357 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
IMP4-209ENST00000462357 ANKRD22Q5VYY1 191 aa20.18■□□□□ 0.82
IMP4-209ENST00000462357 IZUMO3Q5VZ72 239 aa20.18■□□□□ 0.82
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IMP4-209ENST00000462357 PIANPQ8IYJ0 282 aa20.18■□□□□ 0.82
IMP4-209ENST00000462357 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
IMP4-209ENST00000462357 GSDMBQ8TAX9 411 aa20.18■□□□□ 0.82
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IMP4-209ENST00000462357 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
IMP4-209ENST00000462357 ZNF778Q96MU6 729 aa20.18■□□□□ 0.82
IMP4-209ENST00000462357 CMKLR1Q99788 373 aa20.18■□□□□ 0.82
IMP4-209ENST00000462357 EPB41L5Q9HCM4 733 aa20.18■□□□□ 0.82
IMP4-209ENST00000462357 RABGEF1Q9UJ41 708 aa20.18■□□□□ 0.82
IMP4-209ENST00000462357 CCDC187A0A096LP49 1063 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-209ENST00000462357 A0A1W2PQM1 296 aa20.17■□□□□ 0.82
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