RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 CRISPLD1Q9H336 500 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 ALG2Q9H553 416 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 PRDM8Q9NQV8 689 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 C8orf4Q9NR00 106 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 SEC14L3Q9UDX4 400 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 C8GP07360 202 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 CDK9P50750 372 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 ERVK-21P61565 698 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 TLE2Q04725 743 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 LAPTM5Q13571 262 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 PRR23CQ6ZRP0 262 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 UXS1Q8NBZ7 420 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 BTBD9Q96Q07 612 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 PTGFRNQ9P2B2 879 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC17A6Q9P2U8 582 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 YIPF1Q9Y548 306 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 TSC22D2O75157 780 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 SEC24AO95486 1093 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 MSANTD2Q6P1R3 559 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 EQTNQ9NQ60 294 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 SIX4Q9UIU6 781 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 OSTM1Q86WC4 334 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 SRRDQ9UH36 339 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM59LQ9UK28 342 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 WBP4O75554 376 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 PTCHD4Q6ZW05 846 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 CCSER2Q9H7U1 834 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 OR51F1A6NGY5 319 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 UGT2B17O75795 530 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 IRF9Q00978 393 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 KCTD21Q4G0X4 260 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 MZT2AQ6P582 158 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM220AQ7Z4H9 259 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 PRDM4Q9UKN5 801 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 AK5Q9Y6K8 562 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A1W2PRU2 124 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 HCRTO43612 131 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 INCA1Q0VD86 236 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 HDDC2Q7Z4H3 204 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 CROCCP3Q8IVE0 287 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 MOSPD2Q8NHP6 518 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 SH3RF2Q8TEC5 729 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF358Q9NW07 568 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC25A12O75746 678 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 PRPS2P11908 318 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 LIX1Q8N485 282 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 DCAKDQ8WVC6 231 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 ROPN1LQ96C74 230 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 KCNJ11Q14654 390 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 ALG11Q2TAA5 492 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 C7orf61Q8IZ16 206 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 NR1D2Q14995 579 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM63BQ5T3F8 832 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 SNX20Q7Z614 316 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 IZUMO1Q8IYV9 350 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 UBR7Q8N806 425 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC43A3Q8NBI5 491 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 UBASH3BQ8TF42 649 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 ILVBLA1L0T0 632 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 FFAR2O15552 330 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 GCNT6Q5T4J0 391 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 CHRNGP07510 517 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 UNC5BQ8IZJ1 945 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 DNAJA2O60884 412 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 NR2F6P10588 404 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 MAPK12P53778 367 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 SEMG2Q02383 582 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 LRRC73Q5JTD7 316 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 FNIP2Q9P278 1114 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 SH3GLB1Q9Y371 365 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 CTSKP43235 329 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 RALGPS1Q5JS13 557 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 BTBD3Q9Y2F9 522 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 HS3ST4Q9Y661 456 aa21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms