RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 GJD3Q8N144 294 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 OR2T34Q8NGX1 318 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 CCT8L2Q96SF2 557 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 MYOCQ99972 504 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 SGK2Q9HBY8 427 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 TRIM39Q9HCM9 518 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 FAM8A1Q9UBU6 413 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 CYP8B1Q9UNU6 501 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 SLC31A1O15431 190 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 TSPAN12O95859 305 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 CCR7P32248 378 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 INPP5AQ14642 412 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 OR4D1Q15615 310 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 ANKRD12Q6UB98 2062 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 MYO1HQ8N1T3 1032 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 ASB2Q96Q27 587 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 FZD3Q9NPG1 666 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 RNF112Q9ULX5 631 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 TARM1B6A8C7 271 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 CDC7O00311 574 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 NDUFAB1O14561 156 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 SGTAO43765 313 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 DLX3O60479 287 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 CDK3Q00526 305 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 STX3Q13277 289 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 TSNQ15631 228 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 ACSBG2Q5FVE4 666 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 PJA1Q8NG27 643 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 STAG3L4Q8TBR4 150 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 KIAA1191Q96A73 305 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 PITPNM3Q9BZ71 974 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 WDR26Q9H7D7 661 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 LATS2Q9NRM7 1088 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 OXSMQ9NWU1 459 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 ATXN10Q9UBB4 475 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 IKZF3Q9UKT9 509 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 KPNA5O15131 536 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 RAD51BO15315 384 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 TRIM13O60858 407 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 SMIM24O75264 130 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 SEMA4FO95754 770 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 FAM107AO95990 144 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 DRD4P21917 467 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 AOAHP28039 575 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 PRLHRP49683 370 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 HSPA14Q0VDF9 509 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 BST1Q10588 318 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 RHEBL1Q8TAI7 183 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 TPSD1Q9BZJ3 242 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 OR1A2Q9Y585 309 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 NEMP2A6NFY4 417 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 SUPT3HB4E1H0 165 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 KLF11O14901 512 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 VEGFDO43915 354 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 SUPT3HO75486 399 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 SERPINE1P05121 402 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 CBSLP0DN79 551 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 CBSP35520 551 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 KCNC1P48547 511 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 ASPHQ12797 758 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 SYTL3Q4VX76 610 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 LIPMQ5VYY2 423 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 TRIM69Q86WT6 500 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 COX14Q96I36 57 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 CCM2Q9BSQ5 444 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 LGR4Q9BXB1 951 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 CYP4F12Q9HCS2 524 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 KLHL42Q9P2K6 505 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 KERAO60938 352 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 IGFALSP35858 605 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.829e-7■■■□□ 19.2
ATG4B-204ENST00000402096 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 CRTC3Q6UUV7 619 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 FRA10AC1Q70Z53 315 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC126Q96EE4 140 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 TEX101Q9BY14 249 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 CHRDQ9H2X0 955 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 CD320Q9NPF0 282 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 SIT1Q9Y3P8 196 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 A8MT66 165 aa20.15■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 UBXN8O00124 270 aa20.15■□□□□ 0.82
ATG4B-204ENST00000402096 EDF1O60869 148 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms