RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353284.7

PTPRS-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,518 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-202ENST00000353284 TOP1MTQ969P6 601 aa11.93□□□□□ -0.5
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PTPRS-202ENST00000353284 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
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PTPRS-202ENST00000353284 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 CAMKK1Q8N5S9 505 aa11.92□□□□□ -0.5
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PTPRS-202ENST00000353284 CDK15Q96Q40 435 aa11.92□□□□□ -0.5
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PTPRS-202ENST00000353284 ACTR3BQ9P1U1 418 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 PSME2Q9UL46 239 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 SDHDO14521 159 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 SERPINA4P29622 427 aa11.92□□□□□ -0.5
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PTPRS-202ENST00000353284 ITGA1P56199 1179 aa11.92□□□□□ -0.5
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PTPRS-202ENST00000353284 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 TMBIM1Q969X1 311 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 ISOC1Q96CN7 298 aa11.92□□□□□ -0.5
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PTPRS-202ENST00000353284 KLHL1Q9NR64 748 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRS-202ENST00000353284 SLC25A13Q9UJS0 675 aa11.92□□□□□ -0.5
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PTPRS-202ENST00000353284 SYT16Q17RD7 645 aa11.92□□□□□ -0.5
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PTPRS-202ENST00000353284 SLC13A3Q8WWT9 602 aa11.92□□□□□ -0.5
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PTPRS-202ENST00000353284 CYP7B1O75881 506 aa11.92□□□□□ -0.5
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PTPRS-202ENST00000353284 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP11.92□□□□□ -0.5
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PTPRS-202ENST00000353284 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
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