RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328834.9

CNOT10-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT10, Length 2,815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CNOT10-201ENST00000328834 KATNAL1Q9BW62 490 aa14.64□□□□□ -0.07
CNOT10-201ENST00000328834 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa14.64□□□□□ -0.07
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CNOT10-201ENST00000328834 E2F3O00716 465 aa14.64□□□□□ -0.07
CNOT10-201ENST00000328834 PRLP01236 227 aa14.64□□□□□ -0.07
CNOT10-201ENST00000328834 RPS17P08708 135 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
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CNOT10-201ENST00000328834 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CNOT10-201ENST00000328834 FAM171A1Q5VUB5 890 aa14.64□□□□□ -0.07
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CNOT10-201ENST00000328834 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CNOT10-201ENST00000328834 LIMD1Q9UGP4 676 aa14.64□□□□□ -0.07
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CNOT10-201ENST00000328834 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CNOT10-201ENST00000328834 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
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CNOT10-201ENST00000328834 SMYD1Q8NB12 490 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT10-201ENST00000328834 OR4F6Q8NGB9 312 aa14.63□□□□□ -0.07
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CNOT10-201ENST00000328834 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa14.63□□□□□ -0.07
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CNOT10-201ENST00000328834 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa14.63□□□□□ -0.07
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CNOT10-201ENST00000328834 TGFBR1P36897 503 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT10-201ENST00000328834 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CNOT10-201ENST00000328834 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CNOT10-201ENST00000328834 ARSFP54793 590 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT10-201ENST00000328834 NUP107P57740 925 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT10-201ENST00000328834 IL10RBQ08334 325 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT10-201ENST00000328834 MGAT3Q09327 533 aa14.63□□□□□ -0.07
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CNOT10-201ENST00000328834 TNIP2Q8NFZ5 429 aa14.63□□□□□ -0.07
CNOT10-201ENST00000328834 CD200R1Q8TD46 325 aa14.63□□□□□ -0.07
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CNOT10-201ENST00000328834 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
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CNOT10-201ENST00000328834 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT10-201ENST00000328834 ZNF554Q86TJ5 538 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT10-201ENST00000328834 RNF175Q8N4F7 328 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT10-201ENST00000328834 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT10-201ENST00000328834 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
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CNOT10-201ENST00000328834 TRIM54Q9BYV2 358 aa14.62□□□□□ -0.07
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