RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 RTL4Q6ZR62 310 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 MPP5Q8N3R9 675 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 TPK1Q9H3S4 243 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 GALNT8Q9NY28 637 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 KIF1AQ12756 1690 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB6Q15916 424 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 ATG10Q9H0Y0 220 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFS2O75306 463 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 COL6A1P12109 1028 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 WDR4P57081 412 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM32Q13049 653 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 TOMM20Q15388 145 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 NAT8LQ8N9F0 302 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 SLC38A4Q969I6 547 aa20.92■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 DNTTP04053 509 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 OR10G6Q8NH81 332 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 EVA1BQ9NVM1 165 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 CHIT1Q13231 466 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 HERC3Q15034 1050 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 AHSA2Q719I0 299 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 TRPV1Q8NER1 839 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 OR7D4Q8NG98 312 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 FAM210AQ96ND0 272 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM27Q9HBJ8 222 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf109Q9NX04 203 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 DEC1Q9P2X7 70 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 LAMP2P13473 410 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 SCNN1AP37088 669 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 GPD2P43304 727 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 SERPINA9Q86WD7 417 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 SLC43A3Q8NBI5 491 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 NTAN1Q96AB6 310 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 WASF2Q9Y6W5 498 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 CCL22O00626 93 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 STX16O14662 325 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 SCN2BO60939 215 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 AQP4P55087 323 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 RAB43Q86YS6 212 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 GPR65Q8IYL9 337 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 FBXL21Q9UKT6 434 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 TLL2Q9Y6L7 1015 aa20.91■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 MCIDASD6RGH6 385 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 SLC30A4O14863 429 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 MT-ND1P03886 318 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 PRNPP04156 253 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 LIX1Q8N485 282 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 FCRL5Q96RD9 977 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 NECTIN3Q9NQS3 549 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 VNN1O95497 513 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 C8GP07360 202 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 SELPP16109 830 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 SF1Q15637 639 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 OR10A6Q8NH74 314 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 SLC13A3Q8WWT9 602 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 AZIN2Q96A70 460 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 MYBPHLA2RUH7 354 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 IDSP22304 550 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 FLT3LGP49771 235 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFV1P49821 464 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 CCNKO75909 580 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 POP4O95707 220 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 ACSBG2Q5FVE4 666 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 TCEAL5Q5H9L2 206 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 NAT16Q8N8M0 369 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 PEX16Q9Y5Y5 336 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 DGKBQ9Y6T7 804 aa20.9■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 MAGEB17A8MXT2 336 aa20.89■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 CXCR6O00574 342 aa20.89■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 TEX28O15482 410 aa20.89■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 STARP49675 285 aa20.89■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 DPY19L1Q2PZI1 675 aa20.89■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 LINGO4Q6UY18 593 aa20.89■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 CPNE9Q8IYJ1 553 aa20.89■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 HTRA1Q92743 480 aa20.89■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 PSMG2Q969U7 264 aa20.89■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms