RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262963.10

PTPRS-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-201ENST00000262963 PRPS2P11908 318 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 NSG1P42857 185 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 CHRNA4P43681 627 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 LAPTM5Q13571 262 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 TAF13Q15543 124 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 TPGS2Q68CL5 300 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 DEF8Q6ZN54 512 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 FAM220AQ7Z4H9 259 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 FAM124AQ86V42 546 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 FAM47BQ8NA70 645 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 SLC22A17Q8WUG5 538 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 MCMBPQ9BTE3 642 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 OSBPL2Q9H1P3 480 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 EHD3Q9NZN3 535 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 PTGFRNQ9P2B2 879 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 CACNA1SQ13698 1873 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 ELOVL7A1L3X0 281 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 STAT5AP42229 794 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 CAP1Q01518 475 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 LGALS3BPQ08380 585 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 CLEC6AQ6EIG7 209 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 ACDQ96AP0 544 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 RACGAP1Q9H0H5 632 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 PDLIM7Q9NR12 457 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 TEX264Q9Y6I9 313 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 LAMA4Q16363 1823 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 CAPN15O75808 1086 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 F2P00734 622 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 HCAR3P49019 387 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 KCNJ11Q14654 390 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 VPS26BQ4G0F5 336 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 PARGQ86W56 976 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 CPNE9Q8IYJ1 553 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 KREMEN2Q8NCW0 462 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 CRISPLD1Q9H336 500 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 FANCEQ9HB96 536 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 TAS2R1Q9NYW7 299 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 CNTN3Q9P232 1028 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 SPATA2Q9UM82 520 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 ERN1O75460 977 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 SLC25A12O75746 678 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 RPL17P18621 184 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 CYP4F2P78329 520 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 C2orf80Q0P641 193 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 CHIT1Q13231 466 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 GTF2H2Q13888 395 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 NR1D2Q14995 579 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 NDUFAF6Q330K2 333 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 OSTM1Q86WC4 334 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF781Q8N8C0 355 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF248Q8NDW4 579 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF599Q96NL3 588 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 C16orf70Q9BSU1 422 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 FNIP2Q9P278 1114 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 OR2AG2A6NM03 316 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 H7C0S8 307 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 VIPP01282 170 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 GPIP06744 558 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 F7P08709 466 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 PSMD8P48556 350 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF460Q14592 562 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 MTX3Q5HYI7 312 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 MED27Q6P2C8 311 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 IZUMO1Q8IYV9 350 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 GPR135Q8IZ08 494 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 KCTD13Q8WZ19 329 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 SEC14L3Q9UDX4 400 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 CYTH4Q9UIA0 394 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 SESN1Q9Y6P5 492 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 NRP1O14786 923 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 MGRN1O60291 552 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 C8GP07360 202 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 LIPEQ05469 1076 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 RALGDSQ12967 914 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 ITGADQ13349 1161 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 MPP2Q14168 576 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 MZT2BQ6NZ67 158 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 PQLC3Q8N755 202 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 C10orf82Q8WW14 230 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRS-201ENST00000262963 SUSD3Q96L08 255 aa11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.2 ms