RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 KLHL22Q53GT1 634 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 NIPAL1Q6NVV3 410 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ABHD13Q7L211 337 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ZZZ3Q8IYH5 903 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 OXR1Q8N573 874 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 HCAR2Q8TDS4 363 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 NTAN1Q96AB6 310 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 CAMK1GQ96NX5 476 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 FAM83DQ9H4H8 585 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 TLE6Q9H808 572 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 MAGEE1Q9HCI5 957 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 FBXW11Q9UKB1 542 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 MGAT4AQ9UM21 535 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 H0Y858 1186 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ENTPD5O75356 428 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 TRMUO75648 421 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 C1RP00736 705 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 IGFBP4P22692 258 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 EPHA3P29320 983 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 MAXP61244 160 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 FOXM1Q08050 763 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ARSHQ5FYA8 562 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 CERCAMQ5T4B2 595 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 EEF1DP3Q658K8 133 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 GK5Q6ZS86 529 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 PLD5Q8N7P1 536 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 SLC22A18Q96BI1 424 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 KREMEN1Q96MU8 473 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 TAS2R7Q9NYW3 318 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 TLR6Q9Y2C9 796 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 USP20Q9Y2K6 914 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 KCNU1A8MYU2 1149 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 PDPK1O15530 556 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 SCN2BO60939 215 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 COL6A1P12109 1028 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 NR2C1P13056 603 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 KCNA5P22460 613 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 OR1D2P34982 312 aa7.14□□□□□ -1.27
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CPS1-201ENST00000233072 PPP3R1P63098 170 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 RAPSNQ13702 412 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 TUBA3CQ13748 450 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 CCNIQ14094 377 aa7.14□□□□□ -1.27
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CPS1-201ENST00000233072 FAM189A2Q15884 450 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 FNBP1LQ5T0N5 605 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 FUT10Q6P4F1 479 aa7.14□□□□□ -1.27
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CPS1-201ENST00000233072 PACS2Q86VP3 889 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ARL10Q8N8L6 244 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ATAD1Q8NBU5 361 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ELMO3Q96BJ8 720 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 RNF31Q96EP0 1072 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 SLC35G5Q96KT7 338 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 PCDHB18PQ96TA0 734 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 FANCFQ9NPI8 374 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 PITPNM1O00562 1244 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 CCL16O15467 120 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 IFNA6P05013 189 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 MPSTP25325 297 aa7.14□□□□□ -1.27
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CPS1-201ENST00000233072 C2orf80Q0P641 193 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
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CPS1-201ENST00000233072 SLC1A5Q15758 541 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ATAT1Q5SQI0 421 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 SNX20Q7Z614 316 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 OR4K2Q8NGD2 314 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 PSMA8Q8TAA3 256 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 GIPC3Q8TF64 312 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 C5orf34Q96MH7 638 aa7.14□□□□□ -1.27
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CPS1-201ENST00000233072 BRINP2Q9C0B6 783 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 RETREG1Q9H6L5 497 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
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