RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 PLA2G16P53816 162 aa10.45□□□□□ -0.74
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TRPS1-201ENST00000220888 NFATC2Q13469 925 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 TLR1Q15399 786 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 SLC1A5Q15758 541 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 TATDN1Q6P1N9 297 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 STX12Q86Y82 276 aa10.45□□□□□ -0.74
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TRPS1-201ENST00000220888 ART5Q96L15 291 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 SDHAF3Q9NRP4 125 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 FBXL12Q9NXK8 326 aa10.45□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 CEP152O94986 1710 aa10.45□□□□□ -0.74
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TRPS1-201ENST00000220888 ECT2LQ008S8 904 aa10.45□□□□□ -0.74
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TRPS1-201ENST00000220888 CHIT1Q13231 466 aa10.45□□□□□ -0.74
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TRPS1-201ENST00000220888 FMO1Q01740 532 aa10.44□□□□□ -0.74
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TRPS1-201ENST00000220888 CSPG4P5Q96PW8 444 aa10.44□□□□□ -0.74
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TRPS1-201ENST00000220888 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa10.44□□□□□ -0.74
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TRPS1-201ENST00000220888 CCDC162PA2VCL2 907 aa10.44□□□□□ -0.74
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TRPS1-201ENST00000220888 C12orf56Q8IXR9 622 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 DEFB119Q8N690 84 aa10.44□□□□□ -0.74
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TRPS1-201ENST00000220888 GSC2O15499 205 aa10.44□□□□□ -0.74
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TRPS1-201ENST00000220888 UROSP10746 265 aa10.44□□□□□ -0.74
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TRPS1-201ENST00000220888 MED22Q15528 200 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 NRF1Q16656 503 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 EIPR1Q53HC9 387 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 LCN1P1Q5VSP4 162 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 BROXQ5VW32 411 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 ALG1LQ6GMV1 187 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 ECHDC2Q86YB7 292 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM126BQ8IUX1 230 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 FNIP1Q8TF40 1166 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 SAMD11Q96NU1 681 aa10.44□□□□□ -0.74
TRPS1-201ENST00000220888 COMMD4Q9H0A8 199 aa10.44□□□□□ -0.74
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