RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ces2bQ6PDB7 556 aa20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kif18bQ6PFD6 834 aa20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1037Q7TR84 321 aa20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam205cQ80YD3 371 aa20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem214Q8BM55 687 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cwh43Q91YL7 699 aa20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fcf1Q9CTH6 198 aa20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gde1Q9JL56 331 aa20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dio2Q9Z1Y9 266 aa20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gbp6A0A0G2JDV3 611 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Syndig1A2ANU3 258 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cylc2B1AWN8 422 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Speer4f2E9Q366 295 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Il4i1O09046 630 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P01807 119 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tnfsf4P43488 198 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pdx1P52946 284 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Txndc15Q6P6J9 344 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Letm2Q7TNU7 480 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gpr141Q7TQP0 305 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Coq4Q8BGB8 266 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lrch3Q8BVU0 778 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cep57Q8CEE0 500 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rdh13Q8CEE7 334 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ndufs1Q91VD9 727 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AjubaQ91XC0 547 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Clp1Q99LI9 425 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Snx2Q9CWK8 519 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gipc1Q9Z0G0 333 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gbp4A4UUI3 631 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pnldc1B2RXZ1 531 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp938E9Q9G3 579 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp846G3X996 541 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Psmc3O88685 442 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Jak1P52332 1153 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cdh5P55284 784 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lrig1P70193 1091 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Txnl4aP83877 142 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fmo5P97872 533 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cyp2c65Q148B1 490 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lsg1Q3UM18 644 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pnpla1Q3V1D5 599 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fads6Q80UG1 342 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 DglucyQ8BH86 617 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Neu4Q8BZL1 478 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AcmsdQ8R519 336 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr697Q8VFM4 317 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 EedQ921E6 441 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nudt7Q99P30 236 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cyp4f14Q9EP75 524 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cog8Q9JJA2 640 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rps6kb2Q9Z1M4 485 aa20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sppl2cA2A6C4 690 aa20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Apol11bE9PUZ0 337 aa20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P01665 111 aa20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P01666 111 aa20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SpnP15702 395 aa20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adamts8P57110 905 aa20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ybx1P62960 322 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hspa8P63017 646 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pde7aP70453 456 aa20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kir3dl2Q673W2 388 aa20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Krt73Q6NXH9 539 aa20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znf689Q8BKK5 500 aa20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prdm8Q8BZ97 687 aa20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 IlkapQ8R0F6 392 aa20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Med17Q8VCD5 649 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pcdhgc3Q91XX1 934 aa20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atp6v1b1Q91YH6 513 aa20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Glod5Q9D8I3 148 aa20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Stk19Q9JHN8 254 aa20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc7a9Q9QXA6 487 aa20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cib1Q9Z0F4 191 aa20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr839-ps1A0A1D5RMH6 312 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 RfngO09009 332 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Anxa6P14824 673 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CskP41241 450 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ap1s1P61967 158 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Parp3Q3ULW8 533 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sgo2Q7TSY8 1164 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Itln1bQ80ZA0 313 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SgtaQ8BJU0 315 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tgm6Q8BM11 706 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Smad3Q8BUN5 425 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kdelr3Q8R1L4 214 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp940Q8R2Q3 566 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AmotQ8VHG2 1126 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dhx34Q9DBV3 1145 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nif3l1Q9EQ80 376 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Asap1Q9QWY8 1147 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Igkv18-36A0A075B5M9 114 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lgr4A2ARI4 951 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam151bD3YUE4 279 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Acbd4E9Q289 327 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm5145F8VQ88 278 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r176G3UW31 304 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tnfaip1O70479 316 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cd160O88875 185 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 JunbP09450 344 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pdha2P35487 391 aa20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.7 ms