RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636621.1

LINC00598-211, long intergenic non-protein coding RNA 598, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LINC00598, Length 3,241 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00598-211ENST00000636621 ALDH2P05091 517 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 HTR1AP08908 422 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 TCF3P15923 654 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 MSH3P20585 1137 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 MAGEA11P43364 429 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 TBX4P57082 545 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 MAP2K5Q13163 448 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 RPS6KA2Q15349 733 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 NIPAL1Q6NVV3 410 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 FBXL22Q6P050 247 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 ITIH5Q86UX2 942 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 SERINC5Q86VE9 423 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 PLPP6Q8IY26 295 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 SVOPLQ8N434 492 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 DDHD1Q8NEL9 900 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 OR13C4Q8NGS5 318 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 SNX19Q92543 992 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 IGSF8Q969P0 613 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 MUL1Q969V5 352 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 C19orf43Q9BQ61 176 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 OSBPL10Q9BXB5 764 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 CCDC68Q9H2F9 335 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 HPS4Q9NQG7 708 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 ASIC5Q9NY37 505 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 BTRCQ9Y297 605 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 CCL27Q9Y4X3 112 aa6.86□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 ANKRD12Q6UB98 2062 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 M0QZ92 97 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 TPST1O60507 370 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 RAMP2O60895 175 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 SERPINB7O75635 380 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 ALBP02768 609 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 UGT2B4P06133 528 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 THRBP10828 461 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 ITIH1P19827 911 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 CR2P20023 1033 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 PCMT1P22061 227 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 GRIK1P39086 918 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 BRCC3P46736 316 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 NRIP1P48552 1158 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 HK3P52790 923 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 OR4D2P58180 307 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 RELAQ04206 551 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 IL18R1Q13478 541 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 PWP1Q13610 501 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 TSNQ15631 228 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 CCL15Q16663 113 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 TTC23Q5W5X9 447 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 GLYATQ6IB77 296 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 UGT3A1Q6NUS8 523 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 CPNE9Q8IYJ1 553 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 SPARTQ8N0X7 666 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 KCNJ9Q92806 393 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 VMP1Q96GC9 406 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 NSMCE2Q96MF7 247 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF583Q96ND8 569 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 TMEM74Q96NL1 305 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 CSF3RQ99062 836 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 CGREF1Q99674 301 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 SEMA3CQ99985 751 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 SEPT3Q9UH03 358 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 AP3M1Q9Y2T2 418 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 MICAL3Q7RTP6 2002 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 SUPT3HB4E1H0 165 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 MGEA5O60502 916 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 SUPT3HO75486 399 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 NCK1P16333 377 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 SHMT2P34897 504 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 GEN1Q17RS7 908 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 LAIR2Q6ISS4 152 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 PIK3C3Q8NEB9 887 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 CD200R1Q8TD46 325 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 SLC22A17Q8WUG5 538 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 TMBIM1Q969X1 311 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 NRBF2Q96F24 287 aa6.85□□□□□ -1.31
LINC00598-211ENST00000636621 GLT1D1Q96MS3 346 aa6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.9 ms