RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	CLCNKA	P51800	687 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	MC1R	Q01726	317 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	GLOD4	Q9HC38	313 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	FOLR1	P15328	257 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	CHRNA4	P43681	627 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	PTPRCAP	Q14761	206 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	KAZN	Q674X7	775 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	TEX19	Q8NA77	164 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	GPR150	Q8NGU9	434 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	CT55	Q8WUE5	264 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	TTC25	Q96NG3	672 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	DEF6	Q9H4E7	631 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	TLK1	Q9UKI8	766 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	OR2AG2	A6NM03	316 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	VEGFD	O43915	354 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	NDST3	O95803	873 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	PDGFA	P04085	211 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	CTSC	P53634	463 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	DCDC1	P59894	354 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	KLRB1	Q12918	225 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	CHAF1B	Q13112	559 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	DNASE1L3	Q13609	305 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	GTF2H3	Q13889	308 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	MAP7	Q14244	749 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	PDK1	Q15118	436 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	CHRNA6	Q15825	494 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	SLC18A3	Q16572	532 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	TEX44	Q53QW1	395 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	ODF2	Q5BJF6	829 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	DET1	Q7L5Y6	550 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	AVL9	Q8NBF6	648 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	CHP1	Q99653	195 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	MAP3K3	Q99759	626 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	UCK1	Q9HA47	277 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	IL26	Q9NPH9	171 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	RAD18	Q9NS91	495 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	PADI1	Q9ULC6	663 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	POLH	Q9Y253	713 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	KCTD3	Q9Y597	815 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	NBAS	A2RRP1	2371 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	FLNC	Q14315	2725 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	AKR1B10	O60218	316 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	CREG1	O75629	220 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM253	P0C7T8	217 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	EBLN1	P0CF75	366 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	FGF5	P12034	268 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	NFKB1	P19838	968 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	PTPN3	P26045	913 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	HAL	P42357	657 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	CAPZB	P47756	277 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	WNT3A	P56704	352 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	TUBB3	Q13509	450 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	NFE2L1	Q14494	772 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	IL11RA	Q14626	422 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	RPE65	Q16518	533 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		13.23	□□□□□ -0.29

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