RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622166.1

IGHV3-54-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-54 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHV3-54, Length 353 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-54-201ENST00000622166 NANOGP8Q6NSW7 305 aa9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 Q6ZSR9 355 aa9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 ANKS3Q6ZW76 656 aa9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 USP51Q70EK9 711 aa9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 RNF180Q86T96 592 aa9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 HID1Q8IV36 788 aa9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 HOMEZQ8IX15 550 aa9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 RIMKLAQ8IXN7 391 aa9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 KIAA2013Q8IYS2 634 aa9.51□□□□□ -0.89
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IGHV3-54-201ENST00000622166 GIPC2Q8TF65 315 aa9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 TMIGD2Q96BF3 282 aa9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 BIRC7Q96CA5 298 aa9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 TEX37Q96LM6 180 aa9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZBED2Q9BTP6 218 aa9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 NANOGQ9H9S0 305 aa9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 CD274Q9NZQ7 290 aa9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 SUN2Q9UH99 717 aa9.51□□□□□ -0.89
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IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF711Q9Y462 761 aa9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 A0A1B0GVM2 712 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 TMEM88BA6NKF7 163 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 GOLGA8CPA6NN73 597 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 H0YAE9 185 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 GIPC1O14908 333 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 ANKRD28O15084 1053 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 INPP4BO15327 924 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 CLOCKO15516 846 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 FZD6O60353 706 aa9.5□□□□□ -0.89
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IGHV3-54-201ENST00000622166 SNAP91O60641 907 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 STC2O76061 302 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 PRSS23O95084 383 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 GJB5O95377 273 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 CD160O95971 181 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 LDLRP01130 860 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 CDK4P11802 303 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 CDH1P12830 882 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 UGT1A6P19224 532 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 HRH2P25021 359 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 PCSK6P29122 969 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 TTKP33981 857 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 CLCN7P51798 805 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 ESRRGP62508 458 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 PRKCZQ05513 592 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 CACNG1Q06432 222 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 DUSP4Q13115 394 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 PRKG2Q13237 762 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 PWP1Q13610 501 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 CYP51A1Q16850 503 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 RABL3Q5HYI8 236 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 RTP2Q5QGT7 225 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 HECTD3Q5T447 861 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 DLEU7Q6UYE1 221 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 CERS6Q6ZMG9 384 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 LPCAT2Q7L5N7 544 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 SAPCD2Q86UD0 394 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 SFRP1Q8N474 314 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 DHRSXQ8N5I4 330 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 AADATQ8N5Z0 425 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 DNAJB14Q8TBM8 379 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 PROKR1Q8TCW9 393 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 VPS33AQ96AX1 596 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 B3GALT6Q96L58 329 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 LRRC3Q9BY71 257 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 OCEL1Q9H607 264 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 IL17CQ9P0M4 197 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 LHX3Q9UBR4 397 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 CIDEBQ9UHD4 219 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 CDH7Q9ULB5 785 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 OAZ3Q9UMX2 235 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 FADS3Q9Y5Q0 445 aa9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 FAM149AA5PLN7 773 aa9.49□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF840PA6NDX5 716 aa9.49□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR7A17O14581 309 aa9.49□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 COCHO43405 550 aa9.49□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR1I1O60431 355 aa9.49□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 TULP3O75386 442 aa9.49□□□□□ -0.89
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