RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545346.1

QKI-216, Transcript of QKI, KH domain containing RNA binding, humanhuman

TSL 5

Gene QKI, Length 457 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QKI-216ENST00000545346 TMEM175Q9BSA9 504 aa4□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 HDHD5Q9BXW7 423 aa4□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 PDE11AQ9HCR9 933 aa4□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 POLD4Q9HCU8 107 aa4□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 SIX2Q9NPC8 291 aa4□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 TMLHEQ9NVH6 421 aa4□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 RAB20Q9NX57 234 aa4□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 TAB2Q9NYJ8 693 aa4□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 AIPL1Q9NZN9 384 aa4□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 SH3BP4Q9P0V3 963 aa4□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 GCNT4Q9P109 453 aa4□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 SIX4Q9UIU6 781 aa4□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 TSC2P49815 1807 aa4□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 PCNTO95613 3336 aa4□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 PTPRJQ12913 1337 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 SCN1AP35498 2009 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 GOLGA8IPA6NC78 632 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 ARL5CA6NH57 179 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 GOLGA8JA6NMD2 632 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 LACTBL1A8MY62 500 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 F8VZ95 297 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 CNTN5O94779 1100 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 NOL4O94818 638 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 IGLV2-14P01704 120 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 HLA-DRAP01903 254 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 PAEPP09466 180 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 TRIM49P0CI25 452 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 TRIM49CP0CI26 452 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 DLATP10515 647 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 ARSAP15289 507 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 FERP16591 822 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 TYMPP19971 482 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 SLC8A1P32418 973 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 PIK3CAP42336 1068 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 GDF5P43026 501 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP3.99□□□□□ -1.772e-8■■■□□ 15.6
QKI-216ENST00000545346 SOX2P48431 317 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 RGS19P49795 217 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 TAF6P49848 677 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 NOP14P78316 857 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 B4GALNT1Q00973 533 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 SMARCB1Q12824 385 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 CNGA3Q16281 694 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 FAM153CQ494X1 144 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 C10orf76Q5T2E6 689 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 C9orf57Q5W0N0 161 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 JADE1Q6IE81 842 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 CCDC70Q6NSX1 233 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 MTFR2Q6P444 385 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 TMEM65Q6PI78 240 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 RANBP10Q6VN20 620 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 RINLQ6ZS11 566 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 MDGA2Q7Z553 956 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 UNC93AQ86WB7 457 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 HEATR4Q86WZ0 1026 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 ZNF677Q86XU0 584 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 FAM71AQ8IYT1 594 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 CCDC170Q8IYT3 715 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 TMEM86AQ8N2M4 240 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 LRRC43Q8N309 656 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 TC2NQ8N9U0 490 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 NEK11Q8NG66 645 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 URGCPQ8TCY9 931 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 TAS1R2Q8TE23 839 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 CCDC127Q96BQ5 260 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 EEF2KMTQ96G04 330 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 HIC2Q96JB3 615 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 CEP295NLQ96MC4 621 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 PPM1MQ96MI6 270 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 ZNF347Q96SE7 839 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 TM2D2Q9BX73 214 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 MTMR12Q9C0I1 747 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 ASNSD1Q9NWL6 643 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 DPP3Q9NY33 737 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 KIAA1257Q9ULG3 409 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 GINS2Q9Y248 185 aa3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa3.98□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 PTPRSQ13332 1948 aa3.98□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 A0A1W2PPC1 479 aa3.98□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 FAM90A7PA6NKC0 464 aa3.98□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 SAC3D1A6NKF1 404 aa3.98□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 FAM90A22PA8MWA6 464 aa3.98□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 FAM90A12PA8MX19 464 aa3.98□□□□□ -1.77
QKI-216ENST00000545346 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms