RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541990.5

THBS3-211, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 2,928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-211ENST00000541990 INMTO95050 263 aa9.05□□□□□ -0.96
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THBS3-211ENST00000541990 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 TAF10Q12962 218 aa9.05□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 SEPT6Q14141 434 aa9.05□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 SLC25A52Q3SY17 297 aa9.05□□□□□ -0.96
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THBS3-211ENST00000541990 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa9.05□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 SCUBE2Q9NQ36 999 aa9.05□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 SMPD4Q9NXE4 827 aa9.05□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 TMEM9Q9P0T7 183 aa9.05□□□□□ -0.96
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THBS3-211ENST00000541990 FRMPD3Q5JV73 1810 aa9.05□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 CYP11A1P05108 521 aa9.05□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 ATF6P18850 670 aa9.05□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 TGM1P22735 817 aa9.05□□□□□ -0.96
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THBS3-211ENST00000541990 CASP2P42575 452 aa9.05□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 DIO3P55073 304 aa9.05□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 ECT2LQ008S8 904 aa9.05□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
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THBS3-211ENST00000541990 PAGE3Q5JUK9 113 aa9.05□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 ZNF697Q5TEC3 545 aa9.05□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 TMEM236Q5W0B7 351 aa9.05□□□□□ -0.96
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THBS3-211ENST00000541990 TMEM207Q6UWW9 146 aa9.05□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 HACD2Q6Y1H2 254 aa9.05□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 PIM3Q86V86 326 aa9.05□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 PDZD8Q8NEN9 1154 aa9.05□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 C17orf50Q8WW18 174 aa9.05□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 IGSF21Q96ID5 467 aa9.05□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 CLSTN3Q9BQT9 956 aa9.05□□□□□ -0.96
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THBS3-211ENST00000541990 CCDC68Q9H2F9 335 aa9.05□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 ALG9Q9H6U8 611 aa9.05□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 NTN4Q9HB63 628 aa9.05□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 CD320Q9NPF0 282 aa9.05□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 AKIP1Q9NQ31 210 aa9.05□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 AASSQ9UDR5 926 aa9.05□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa9.05□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa9.05□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 ANKRD12Q6UB98 2062 aa9.04□□□□□ -0.96
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THBS3-211ENST00000541990 PIGAP37287 484 aa9.04□□□□□ -0.96
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THBS3-211ENST00000541990 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa9.04□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 C14orf80Q86SX3 495 aa9.04□□□□□ -0.96
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THBS3-211ENST00000541990 RAB2BQ8WUD1 216 aa9.04□□□□□ -0.96
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THBS3-211ENST00000541990 COLEC11Q9BWP8 271 aa9.04□□□□□ -0.96
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THBS3-211ENST00000541990 BROXQ5VW32 411 aa9.04□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 PKN3Q6P5Z2 889 aa9.04□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 CNKSR3Q6P9H4 555 aa9.04□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa9.04□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 TTC39CQ8N584 583 aa9.04□□□□□ -0.96
THBS3-211ENST00000541990 TERB1Q8NA31 727 aa9.04□□□□□ -0.96
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