RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516877.1

RNU6-1234P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1234, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1234P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1234P-201ENST00000516877 SHISA9B4DS77 424 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1234P-201ENST00000516877 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1234P-201ENST00000516877 NBNO60934 754 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CSF1P09603 554 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1234P-201ENST00000516877 OXTRP30559 389 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1234P-201ENST00000516877 OPRL1P41146 370 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1234P-201ENST00000516877 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP0.59□□□□□ -2.31
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RNU6-1234P-201ENST00000516877 CLDN20P56880 219 aa0.59□□□□□ -2.31
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RNU6-1234P-201ENST00000516877 CD300CQ08708 224 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1234P-201ENST00000516877 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1234P-201ENST00000516877 P2RY6Q15077 328 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1234P-201ENST00000516877 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
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RNU6-1234P-201ENST00000516877 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
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RNU6-1234P-201ENST00000516877 LRP11Q86VZ4 500 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1234P-201ENST00000516877 LYPD1Q8N2G4 141 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1234P-201ENST00000516877 DNAJC22Q8N4W6 341 aa0.59□□□□□ -2.31
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RNU6-1234P-201ENST00000516877 CENPTQ96BT3 561 aa0.59□□□□□ -2.31
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RNU6-1234P-201ENST00000516877 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1234P-201ENST00000516877 SLC32A1Q9H598 525 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1234P-201ENST00000516877 PCDH12Q9NPG4 1184 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1234P-201ENST00000516877 NDE1Q9NXR1 346 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TAB2Q9NYJ8 693 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1234P-201ENST00000516877 FBXL17Q9UF56 701 aa0.59□□□□□ -2.31
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RNU6-1234P-201ENST00000516877 NCK2O43639 380 aa0.58□□□□□ -2.32
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RNU6-1234P-201ENST00000516877 THY1P04216 161 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1234P-201ENST00000516877 THEGLP0DJG4 465 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1234P-201ENST00000516877 HSPA7P48741 367 aa0.58□□□□□ -2.32
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RNU6-1234P-201ENST00000516877 GPR17Q13304 367 aa0.58□□□□□ -2.32
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RNU6-1234P-201ENST00000516877 PAF1Q8N7H5 531 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1234P-201ENST00000516877 NIPA2Q8N8Q9 360 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1234P-201ENST00000516877 MRAPQ8TCY5 172 aa0.58□□□□□ -2.32
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RNU6-1234P-201ENST00000516877 NPRL2Q8WTW4 380 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1234P-201ENST00000516877 HPSE2Q8WWQ2 592 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
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RNU6-1234P-201ENST00000516877 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1234P-201ENST00000516877 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1234P-201ENST00000516877 GTF3C4Q9UKN8 822 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1234P-201ENST00000516877 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1234P-201ENST00000516877 NACAE9PAV3 2078 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1234P-201ENST00000516877 FAM168BA1KXE4 195 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1234P-201ENST00000516877 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1234P-201ENST00000516877 VSTM5A8MXK1 200 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1234P-201ENST00000516877 DNM1LO00429 736 aa0.57□□□□□ -2.32
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