RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514705.5

TSPAN17-208, Transcript of tetraspanin 17, human

TSL 2

Gene TSPAN17, Length 4,445 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSPAN17-208	ENST00000514705	SH3BGRL	O75368	114 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	TRAF3	Q13114	568 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	CCL14	Q16627	93 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	ISCA2	Q86U28	154 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	TPD52L3	Q96J77	140 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	MYRFL	Q96LU7	910 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	C8orf4	Q9NR00	106 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	EPS8	Q12929	822 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	C6orf183	Q5T699	404 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	MCFD2	Q8NI22	146 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	XPNPEP2	O43895	674 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	C1R	P00736	705 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	IRF1	P10914	325 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	CD247	P20963	164 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	HLCS	P50747	726 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	CLCN2	P51788	898 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	KCTD11	Q693B1	232 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	MTRR	Q9UBK8	725 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705		A8MX80	341 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	BCKDK	O14874	412 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	ECI2	O75521	394 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	LRAT	O95237	230 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	RAP2A	P10114	183 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	GPX3	P22352	226 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	CYP4F2	P78329	520 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	CYP4F3	Q08477	520 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	C14orf80	Q86SX3	495 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	ANKRD46	Q86W74	232 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	BBS2	Q9BXC9	721 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	LHPP	Q9H008	270 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	IRAK2	O43187	625 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	CD97	P48960	835 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	DEFA1	P59665	94 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	DEFA3	P59666	94 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705		Q6ZNX1	250 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	HID1	Q8IV36	788 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	OR8H2	Q8N162	312 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	SETD9	Q8NE22	299 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	ISL2	Q96A47	359 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	PTER	Q96BW5	349 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	OR52E6	Q96RD3	313 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705		H0Y858	1186 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	ABCB7	O75027	752 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	GRK4	P32298	578 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	GRB14	Q14449	540 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	DET1	Q7L5Y6	550 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	PDPR	Q8NCN5	879 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	S100Z	Q8WXG8	99 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	CLPB	Q9H078	707 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	COL1A2	P08123	1366 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705		F5H5T6	163 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	PRKD3	O94806	890 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	UROS	P10746	265 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	ALDH3A2	P51648	485 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	ATP6AP1	Q15904	470 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	SLC36A3	Q495N2	470 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	LGI2	Q8N0V4	545 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	APOL4	Q9BPW4	351 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	AMBN	Q9NP70	447 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TSPAN17-208	ENST00000514705	TRIP11	Q15643	1979 aa		13.74	□□□□□ -0.21

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