RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513072.1

ANKRD40-203, Transcript of ankyrin repeat domain 40, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD40, Length 848 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40-203ENST00000513072 GRHPRQ9UBQ7 328 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 YIPF1Q9Y548 306 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 NBEAQ8NFP9 2946 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 CPLX1O14810 134 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 PPEF2O14830 753 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 EPN2O95208 641 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 ZNF806P0C7X5 589 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 FDPSP14324 419 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP5.49□□□□□ -1.531e-7■□□□□ 10.5
ANKRD40-203ENST00000513072 ELF1P32519 619 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 CPA2P48052 419 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 SLC12A2P55011 1212 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 SPAG1Q07617 926 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 FCHO2Q0JRZ9 810 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 MAPK6Q16659 721 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 CTXN3Q4LDR2 81 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 ATF7IP2Q5U623 682 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 GALNT17Q6IS24 598 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 PDXDC1Q6P996 788 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 TMEM88Q6PEY1 159 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 ALKAL1Q6UXT8 129 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 FAM57BQ71RH2 274 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 RUFY3Q7L099 469 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 RTL10Q7L3V2 364 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 RAB11FIP2Q7L804 512 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 CATSPER3Q86XQ3 398 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 BEST2Q8NFU1 509 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 CLEC4CQ8WTT0 213 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 NPAS1Q99742 590 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 PTPRHQ9HD43 1115 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 ASAH2Q9NR71 780 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 PCDHA12Q9UN75 941 aa5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 BPTFQ12830 3046 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 ATG2BQ96BY7 2078 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 TRIP11Q15643 1979 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 TBC1D3EA0A087X179 549 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 LNP1A1A4G5 178 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 TBC1D3BA6NDS4 549 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 C4orf47A7E2U8 309 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 BTBD18B2RXH4 712 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 TBC1D3LB9A6J9 549 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 ZNF197O14709 1029 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 SYN3O14994 580 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 CHADO15335 359 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 NEMFO60524 1076 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 EGFP01133 1207 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 TBC1D3HP0C7X1 549 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 ARSAP15289 507 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 CYP11B2P19099 503 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 TFEBP19484 476 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 TGM2P21980 687 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 HOXA6P31267 233 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 ST3GAL1Q11201 340 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 RABEP1Q15276 862 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 CALCRLQ16602 461 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 TBRG1Q3YBR2 411 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 PLK5Q496M5 336 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 GALNTL6Q49A17 601 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 CYP4A22Q5TCH4 519 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 ZNF280DQ6N043 979 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 DAW1Q8N136 415 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 ATAD1Q8NBU5 361 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 STKLD1Q8NE28 680 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 MCPH1Q8NEM0 835 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 OR52N4Q8NGI2 321 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 ZFPM2Q8WW38 1151 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 ATP2A3Q93084 1043 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 ADPGKQ9BRR6 497 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 EDEM2Q9BV94 578 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 SCNM1Q9BWG6 230 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 C2orf40Q9H1Z8 148 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 HPS4Q9NQG7 708 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 CCL26Q9Y258 94 aa5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
ANKRD40-203ENST00000513072 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms