RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509593.1

ABCE1-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily E member 1, human

TSL 5

Gene ABCE1, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCE1-208	ENST00000509593	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ABCE1-208	ENST00000509593	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ABCE1-208	ENST00000509593	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ABCE1-208	ENST00000509593	HAO1	Q9UJM8	370 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ABCE1-208	ENST00000509593	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
ABCE1-208	ENST00000509593	FZD10	Q9ULW2	581 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ABCE1-208	ENST00000509593	NUDC	Q9Y266	331 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ABCE1-208	ENST00000509593	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ABCE1-208	ENST00000509593	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ABCE1-208	ENST00000509593	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
ABCE1-208	ENST00000509593	CASZ1	Q86V15	1759 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ABCE1-208	ENST00000509593	MAP3K5	Q99683	1374 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ABCE1-208	ENST00000509593	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ABCE1-208	ENST00000509593	MEGF6	O75095	1541 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	C1orf226	A1L170	272 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	LRRC53	A6NM62	1247 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	USP17L23	D6RBM5	183 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	CHL1	O00533	1208 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	TIMM44	O43615	452 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	NKX2-2	O95096	273 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	GAS8-AS1	O95177	125 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	PPP1R3D	O95685	299 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	STARD3NL	O95772	234 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	FTCD	O95954	541 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	MMP10	P09238	476 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	TPM1	P09493	284 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	TFPI	P10646	304 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	GNLY	P22749	145 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	ARL3	P36405	182 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	GPR12	P47775	334 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	TRPC1	P48995	793 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	MC1R	Q01726	317 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	PRKG2	Q13237	762 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	KCTD2	Q14681	263 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	ARHGEF6	Q15052	776 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	SYCP1	Q15431	976 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	CCNG2	Q16589	344 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	MMEL1	Q495T6	779 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	MTSS1L	Q765P7	747 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	NR4A3	Q92570	626 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	RND1	Q92730	232 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	IGSF8	Q969P0	613 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	SPRY4	Q9C004	299 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	VPS28	Q9UK41	221 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	LY75	O60449	1722 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	ITGB4	P16144	1822 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	MYOM1	P52179	1685 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593		A0A0G2JLW4	131 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	ERICH4	A6NGS2	130 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	TIMM23	O14925	209 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	GRID2	O43424	1007 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	TPPP	O94811	219 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	ZNF432	O94892	652 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	GLUD1	P00367	558 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	PRSS2	P07478	247 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	HMOX1	P09601	288 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	G6PD	P11413	515 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	SELL	P14151	372 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	GABRB1	P18505	474 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	ALDH1B1	P30837	517 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	USP8	P40818	1118 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	PRPH	P41219	470 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	GLUD2	P49448	558 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	ART1	P52961	327 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	ZP1	P60852	638 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	SORD	Q00796	357 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ABCE1-208	ENST00000509593	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		3.2	□□□□□ -1.9

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