RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		3.13	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	SEMA3C	Q99985	751 aa		3.13	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		3.13	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	PIGM	Q9H3S5	423 aa		3.13	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		3.13	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		3.13	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	TSPAN4	O14817	238 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	PLPP2	O43688	288 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	PI15	O43692	258 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	GCNT3	O95395	438 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	ICAM1	P05362	532 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	HMBS	P08397	361 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	TYMP	P19971	482 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	ITGA3	P26006	1051 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	HAL	P42357	657 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	SLC6A12	P48065	614 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	MMP15	P51511	669 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	OLIG2	Q13516	323 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	PTOV1	Q86YD1	416 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	SLC5A8	Q8N695	610 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	PAF1	Q8N7H5	531 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	ZNF611	Q8N823	705 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	PSMD1	Q99460	953 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	LAT2	Q9GZY6	243 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	STK39	Q9UEW8	545 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		3.12	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	ATP2A1	O14983	1001 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	JRK	O75564	520 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	BMP10	O95393	424 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	CEBPB	P17676	345 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	SNX16	P57768	344 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	BAK1	Q16611	211 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	GTDC1	Q4AE62	458 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	DOK6	Q6PKX4	331 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	TSSK4	Q6SA08	328 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	EMC1	Q8N766	993 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	OR2T12	Q8NG77	320 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	SEMA4D	Q92854	862 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	EGLN2	Q96KS0	407 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	HARBI1	Q96MB7	349 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	TMEM68	Q96MH6	324 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	VEZT	Q9HBM0	779 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		3.11	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	PLK4	O00444	970 aa		3.1	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	TGFB1I1	O43294	461 aa		3.1	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	RAF1	P04049	648 aa		3.1	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	FAM157C	P0CG43	387 aa		3.1	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	SELL	P14151	372 aa		3.1	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	ACADS	P16219	412 aa		3.1	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	CBL	P22681	906 aa		3.1	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	HRH2	P25021	359 aa		3.1	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	ICAM3	P32942	547 aa		3.1	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	THOP1	P52888	689 aa		3.1	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	F2RL1	P55085	397 aa		3.1	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	KCNJ10	P78508	379 aa		3.1	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	TLE2	Q04725	743 aa		3.1	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	ZNF774	Q6NX45	483 aa		3.1	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268		Q6ZSR9	355 aa		3.1	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		3.1	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	TMEM143	Q96AN5	459 aa		3.1	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	RNF125	Q96EQ8	232 aa		3.1	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		3.1	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		3.1	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	GFI1	Q99684	422 aa		3.1	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	PPCS	Q9HAB8	311 aa		3.1	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	TBX20	Q9UMR3	447 aa		3.1	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	YIPF1	Q9Y548	306 aa		3.1	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	TTC36	A6NLP5	189 aa		3.09	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	F9	P00740	461 aa		3.09	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	ABCD3	P28288	659 aa		3.09	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
USP34-222	ENST00000498268	UGP2	Q16851	508 aa		3.09	□□□□□ -1.91

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