RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-208ENST00000495423 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 MFSD7Q6UXD7 560 aa22.8■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 PQLC3Q8N755 202 aa22.8■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 FATE1Q969F0 183 aa22.8■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 C9orf72Q96LT7 481 aa22.8■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 BRD8Q9H0E9 1235 aa22.8■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 CARD9Q9H257 536 aa22.8■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 UCK1Q9HA47 277 aa22.8■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 PRDM8Q9NQV8 689 aa22.8■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 CROTQ9UKG9 612 aa22.8■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 APOL1O14791 398 aa22.79■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
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SIMC1-208ENST00000495423 ACP5P13686 325 aa22.79■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 TNNT1P13805 278 aa22.79■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF28P17035 718 aa22.79■■□□□ 1.24
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SIMC1-208ENST00000495423 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
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SIMC1-208ENST00000495423 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa22.79■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 ASB18Q6ZVZ8 466 aa22.79■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 ALG3Q92685 438 aa22.79■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 WDR24Q96S15 920 aa22.79■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 LYSMD1Q96S90 227 aa22.79■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa22.78■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 RFPL1O75677 317 aa22.78■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 RECKO95980 971 aa22.78■■□□□ 1.24
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SIMC1-208ENST00000495423 EPHB1P54762 984 aa22.78■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 GFERP55789 205 aa22.78■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 FOXM1Q08050 763 aa22.78■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 ERV3-1Q14264 604 aa22.78■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 OGFRQ9NZT2 677 aa22.78■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 SNX2O60749 519 aa22.77■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 CLDN7O95471 211 aa22.77■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 PMS2P54278 862 aa22.77■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 GALNT2Q10471 571 aa22.77■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 IL11RAQ14626 422 aa22.77■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 BBS12Q6ZW61 710 aa22.77■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 CCDC50Q8IVM0 306 aa22.77■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 PLD5Q8N7P1 536 aa22.77■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 GALNT6Q8NCL4 622 aa22.77■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 TSGA13Q96PP4 275 aa22.77■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 OSBPL8Q9BZF1 889 aa22.77■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
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SIMC1-208ENST00000495423 TLK1Q9UKI8 766 aa22.77■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa22.77■■□□□ 1.24
SIMC1-208ENST00000495423 FADS2P1A8MWK0 482 aa22.76■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 NUAK1O60285 661 aa22.76■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 TJP3O95049 919 aa22.76■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 PRLP01236 227 aa22.76■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
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SIMC1-208ENST00000495423 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa22.76■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa22.76■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 CHKBQ9Y259 395 aa22.76■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa22.76■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 GRID2O43424 1007 aa22.75■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 SPINT3P49223 89 aa22.75■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 ITKQ08881 620 aa22.75■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 PDK1Q15118 436 aa22.75■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
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SIMC1-208ENST00000495423 TMEM26Q6ZUK4 368 aa22.75■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 GALNT11Q8NCW6 608 aa22.75■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 MAML1Q92585 1016 aa22.75■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 HDAC11Q96DB2 347 aa22.75■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa22.75■■□□□ 1.23
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SIMC1-208ENST00000495423 FAM83DQ9H4H8 585 aa22.75■■□□□ 1.23
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SIMC1-208ENST00000495423 RGSL1A5PLK6 1076 aa22.74■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa22.74■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 MFSD11O43934 449 aa22.74■■□□□ 1.23
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SIMC1-208ENST00000495423 KIAA0754O94854 1291 aa22.74■■□□□ 1.23
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SIMC1-208ENST00000495423 APOC2P02655 101 aa22.74■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 PYGMP11217 842 aa22.74■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 FGF5P12034 268 aa22.74■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 CA4P22748 312 aa22.74■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 GARSP41250 739 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 UQCRFS1P47985 274 aa22.74■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 SH3BP2P78314 561 aa22.74■■□□□ 1.23
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