RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A1W2PPI3 338 aa4.26□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PI4KAP2A4QPH2 592 aa4.26□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BUD23O43709 281 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PDE9AO76083 593 aa4.26□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRSS1P07477 247 aa4.26□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM11P17152 192 aa4.26□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MSH2P43246 934 aa4.26□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRAMEP78395 509 aa4.26□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRMPQ12912 555 aa4.26□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAMLD1Q13495 774 aa4.26□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MVPQ14764 893 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIR2DS3Q14952 304 aa4.26□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIR2DS5Q14953 304 aa4.26□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa4.26□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TPRG1Q6ZUI0 275 aa4.26□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANO5Q75V66 913 aa4.26□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ABHD8Q96I13 439 aa4.26□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GAD1Q99259 594 aa4.26□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLX1AQ9BQ83 275 aa4.26□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLK3Q9H4B4 646 aa4.26□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KAT14Q9H8E8 782 aa4.26□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMC4Q9NTJ3 1288 aa4.26□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TSPYL4Q9UJ04 414 aa4.26□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa4.26□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa4.26□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MYO1GB0I1T2 1018 aa4.25□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 J3QR06 171 aa4.25□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TFAP2AP05549 437 aa4.25□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GABRB1P18505 474 aa4.25□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MCCP23508 829 aa4.25□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARL3P36405 182 aa4.25□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CAMPP49913 170 aa4.25□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MLLT10P55197 1068 aa4.25□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC35E4Q6ICL7 350 aa4.25□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADAM5Q6NVV9 412 aa4.25□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM180BQ6P0A1 224 aa4.25□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC27A1Q6PCB7 646 aa4.25□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF534Q76KX8 674 aa4.25□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GBGT1Q8N5D6 347 aa4.25□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PAF1Q8N7H5 531 aa4.25□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RDM1Q8NG50 284 aa4.25□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GSDMBQ8TAX9 411 aa4.25□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FBXO17Q96EF6 278 aa4.25□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DUX3Q96PT4 197 aa4.25□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF696Q9H7X3 374 aa4.25□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRPC7Q9HCX4 862 aa4.25□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PAG1Q9NWQ8 432 aa4.25□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SESN1Q9Y6P5 492 aa4.25□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR2M5A3KFT3 312 aa4.24□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PMS2P5A8MQ11 134 aa4.24□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMCC2O75069 709 aa4.24□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PTP4A3O75365 173 aa4.24□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ACADMP11310 421 aa4.24□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ACTN1P12814 892 aa4.24□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CD81P60033 236 aa4.24□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRT71Q3SY84 523 aa4.24□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WDR38Q5JTN6 314 aa4.24□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC30Q5VVM6 783 aa4.24□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARHGAP17Q68EM7 881 aa4.24□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAATS1Q7Z4T9 603 aa4.24□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TICAM1Q8IUC6 712 aa4.24□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TEX19Q8NA77 164 aa4.24□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF354BQ96LW1 612 aa4.24□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 F2RL3Q96RI0 385 aa4.24□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NCAPGQ9BPX3 1015 aa4.24□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SH2D4AQ9H788 454 aa4.24□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRT84Q9NSB2 600 aa4.24□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OGFRQ9NZT2 677 aa4.24□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FBXL17Q9UF56 701 aa4.24□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CMAHPQ9Y471 501 aa4.24□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 YIPF1Q9Y548 306 aa4.24□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.23□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A1W2PR77 199 aa4.23□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SERINC4A6NH21 518 aa4.23□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa4.23□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HS6ST1O60243 411 aa4.23□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPC4O75487 556 aa4.23□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GCNT3O95395 438 aa4.23□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MSH3P20585 1137 aa4.23□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NR2F2P24468 414 aa4.23□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDH8P55286 799 aa4.23□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MBTD1Q05BQ5 628 aa4.23□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IKQ13123 557 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UBE2V1Q13404 147 aa4.23□□□□□ -1.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CRYMQ14894 314 aa4.23□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms