RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493945.5

ACTB-213, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,236 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-213ENST00000493945 PAFAH2Q99487 392 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 TIMM29Q9BSF4 260 aa14.72□□□□□ -0.05
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ACTB-213ENST00000493945 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-213ENST00000493945 CYP4F12Q9HCS2 524 aa14.72□□□□□ -0.05
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ACTB-213ENST00000493945 TAS2R13Q9NYV9 303 aa14.72□□□□□ -0.05
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ACTB-213ENST00000493945 HM13Q8TCT9 377 aa14.71□□□□□ -0.05
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ACTB-213ENST00000493945 CSF2P04141 144 aa14.7□□□□□ -0.06
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ACTB-213ENST00000493945 TMEM159Q96B96 161 aa14.7□□□□□ -0.06
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ACTB-213ENST00000493945 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
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ACTB-213ENST00000493945 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 MGAT4DA6NG13 374 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 RASGRF2O14827 1237 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 DNAJC6O75061 913 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 TRIM16O95361 564 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 AHSGP02765 367 aa14.69□□□□□ -0.06
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