RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
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PRAME-212ENST00000485532 RAB15P59190 212 aa12.44□□□□□ -0.42
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PRAME-212ENST00000485532 KIR2DS5Q14953 304 aa12.44□□□□□ -0.42
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PRAME-212ENST00000485532 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
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PRAME-212ENST00000485532 SLC25A51Q9H1U9 297 aa12.44□□□□□ -0.42
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PRAME-212ENST00000485532 SNX12Q9UMY4 172 aa12.44□□□□□ -0.42
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PRAME-212ENST00000485532 GPR39O43194 453 aa12.43□□□□□ -0.42
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PRAME-212ENST00000485532 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
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PRAME-212ENST00000485532 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
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PRAME-212ENST00000485532 COLEC12Q5KU26 742 aa12.43□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 CEACAM20Q6UY09 585 aa12.43□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 TGM7Q96PF1 710 aa12.43□□□□□ -0.42
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PRAME-212ENST00000485532 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
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PRAME-212ENST00000485532 PRR19A6NJB7 356 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 OR5K4A6NMS3 321 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 PDZK1P1A8MUH7 402 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 KMOO15229 486 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 UBXN7O94888 489 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 NDST3O95803 873 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 DLGAP3O95886 979 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 C9P02748 559 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 PYGMP11217 842 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 SFTPCP11686 197 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 F8A1P23610 371 aa12.42□□□□□ -0.42
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PRAME-212ENST00000485532 CXCR5P32302 372 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 CD68P34810 354 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 CHRNA4P43681 627 aa12.42□□□□□ -0.42
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PRAME-212ENST00000485532 SKIDA1Q1XH10 827 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 TEX44Q53QW1 395 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 KAZNQ674X7 775 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 TMEM26Q6ZUK4 368 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 LRRTM4Q86VH4 590 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 PLXDC1Q8IUK5 500 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 TRIM48Q8IWZ4 208 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 COG1Q8WTW3 980 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 RSC1A1Q92681 617 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 ELMO2Q96JJ3 720 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 SLC45A3Q96JT2 553 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 C9orf72Q96LT7 481 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 WDR37Q9Y2I8 494 aa12.42□□□□□ -0.42
PRAME-212ENST00000485532 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP12.42□□□□□ -0.42
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