RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 CLCN5P51795 746 aa7.6□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 OLR1P78380 273 aa7.6□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 RUNDC3AQ59EK9 446 aa7.6□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 TBCELQ5QJ74 424 aa7.6□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 CERCAMQ5T4B2 595 aa7.6□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa7.6□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa7.6□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 AFTPHQ6ULP2 937 aa7.6□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 PRR23CQ6ZRP0 262 aa7.6□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 ADCK2Q7Z695 626 aa7.6□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 TEX26Q8N6G2 289 aa7.6□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 SNX31Q8N9S9 440 aa7.6□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 ISL2Q96A47 359 aa7.6□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 MYO19Q96H55 970 aa7.6□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 ELMO2Q96JJ3 720 aa7.6□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 SEMA3CQ99985 751 aa7.6□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 OSER1Q9NX31 292 aa7.6□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 PCDHGB4Q9UN71 923 aa7.6□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 ZNF840PA6NDX5 716 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 LEFTY2O00292 366 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 ABLIM3O94929 683 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 PGM3O95394 542 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 ADH1BP00325 375 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 DRD1P21728 446 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 BGNP21810 368 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 ATP6V1E1P36543 226 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 TALDO1P37837 337 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 ETV4P43268 484 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 TTPAP49638 278 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 CRADDP78560 199 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 ECT2LQ008S8 904 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 POU4F1Q01851 419 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 PRKCQQ04759 706 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 TRIQKQ629K1 86 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 CERS6Q6ZMG9 384 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 OTOAQ7RTW8 1153 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 GALNT7Q86SF2 657 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 DCAF4L2Q8NA75 395 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 OR7A2PQ8NGA2 310 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 FAM162AQ96A26 154 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 CWH43Q9H720 699 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 GMEB2Q9UKD1 530 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 CCDC162PA2VCL2 907 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 PDLIM1O00151 329 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 DYRK3O43781 588 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 USP12O75317 370 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 KRT36O76013 467 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 CATP04040 527 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 RBP1P09455 135 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 GALK1P51570 392 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 ANGPT1Q15389 498 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 DHFR2Q86XF0 187 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 FBXW8Q8N3Y1 598 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 FAM13CQ8NE31 585 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 ATL1Q8WXF7 558 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 RAB7BQ96AH8 199 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 PHF21AQ96BD5 680 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 SNX15Q9NRS6 342 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 PLK2Q9NYY3 685 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 ATP6V1HQ9UI12 483 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 DYRK1BQ9Y463 629 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 A0A096LPK6 155 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 I6L893 689 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 SLC7A4O43246 635 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 ENTPD5O75356 428 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 RPIAP49247 311 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 C1DQ13901 141 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 POU6F1Q14863 301 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 TYSND1Q2T9J0 566 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 PDZK1Q5T2W1 519 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 RNF220Q5VTB9 566 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 MBLAC2Q68D91 279 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 TXNDC8Q6A555 127 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 BRAT1Q6PJG6 821 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 KRT74Q7RTS7 529 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 IFNEQ86WN2 208 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 CNTD1Q8N815 330 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 KBTBD8Q8NFY9 601 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 TADA1Q96BN2 335 aa7.59□□□□□ -1.19
USP54-210ENST00000466048 SIPA1Q96FS4 1042 aa7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms