RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447419.6

PTX4-203, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTX4, Length 1,516 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-203ENST00000447419 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 A6NCN8 305 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 OR52A4PA6NMU1 304 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 AGAP14A8MT82 685 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 H7C0S8 307 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 CSO75390 466 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 CDK4P11802 303 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 FOXN2P32314 431 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 PRAMEP78395 509 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 SEMA3AQ14563 771 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 CASC4Q6P4E1 433 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 IYDQ6PHW0 289 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 USP53Q70EK8 1073 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 SPRED1Q7Z699 444 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 AMZ2Q86W34 360 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 SFRP1Q8N474 314 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 MFSD3Q96ES6 412 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 KRT12Q99456 494 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 TIMM29Q9BSF4 260 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 TRABD2BA6NFA1 517 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 GOLGA8KD6RF30 607 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 GOLGA8TH3BQL2 631 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 TTI1O43156 1089 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 B4GAT1O43505 415 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 OR1I1O60431 355 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 F3P13726 295 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 BRAFP15056 766 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 NPY2RP49146 381 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 SPIDRQ14159 915 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 GPR33Q49SQ1 333 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 CDCP2Q5VXM1 449 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 MDM1Q8TC05 714 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 TRIM31Q9BZY9 425 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 IL22Q9GZX6 179 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 LRRN3Q9H3W5 708 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 PRSS21Q9Y6M0 314 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 FREM2Q5SZK8 3169 aa20.16■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa20.16■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 PMS2P1A4D2B8 440 aa20.16■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 POLBP06746 335 aa20.16■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 RALBP11234 206 aa20.16■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 MAGEA6P43360 314 aa20.16■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 MAPK9P45984 424 aa20.16■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 CDK16Q00536 496 aa20.16■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 DR1Q01658 176 aa20.16■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 HHEXQ03014 270 aa20.16■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 C2orf54Q08AI8 447 aa20.16■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 CAMK2BQ13554 666 aa20.16■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 AFTPHQ6ULP2 937 aa20.16■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa20.16■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa20.16■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 OR4L1Q8NH43 312 aa20.16■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa20.16■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 SERPINB12Q96P63 405 aa20.16■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 PCYOX1Q9UHG3 505 aa20.16■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 FAM221BA6H8Z2 402 aa20.15■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 BANF1O75531 89 aa20.15■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 F7P08709 466 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 IDSP22304 550 aa20.15■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 MPSTP25325 297 aa20.15■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 PDX1P52945 283 aa20.15■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 SARNPP82979 210 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 PTK6Q13882 451 aa20.15■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 CLCA4Q14CN2 919 aa20.15■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 FOXR1Q6PIV2 292 aa20.15■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 NAPRTQ6XQN6 538 aa20.15■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 JAMLQ86YT9 394 aa20.15■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP20.15■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 NAT8LQ8N9F0 302 aa20.15■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 OR6C4Q8NGE1 309 aa20.15■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 ZNF592Q92610 1267 aa20.15■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 PWWP2AQ96N64 755 aa20.15■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 DEPDC7Q96QD5 511 aa20.15■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 PTPRBP23467 1997 aa20.14■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
PTX4-203ENST00000447419 ASXL3Q9C0F0 2248 aa20.14■□□□□ 0.81
PTX4-203ENST00000447419 PRR19A6NJB7 356 aa20.14■□□□□ 0.81
PTX4-203ENST00000447419 CFAP99D6REC4 459 aa20.14■□□□□ 0.81
PTX4-203ENST00000447419 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PTX4-203ENST00000447419 VCLP18206 1134 aa20.14■□□□□ 0.81
PTX4-203ENST00000447419 PSMA3P25788 255 aa20.14■□□□□ 0.81
PTX4-203ENST00000447419 CLCNKAP51800 687 aa20.14■□□□□ 0.81
PTX4-203ENST00000447419 ACVR1Q04771 509 aa20.14■□□□□ 0.81
PTX4-203ENST00000447419 LAMB3Q13751 1172 aa20.14■□□□□ 0.81
PTX4-203ENST00000447419 ISXQ2M1V0 245 aa20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.8 ms