RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438490.2

RALGAPB-204, Transcript of Ral GTPase activating protein non-catalytic beta subunit, human

TSL 5

Gene RALGAPB, Length 4,075 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RALGAPB-204	ENST00000438490	PHF21B	Q96EK2	531 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ZNF382	Q96SR6	550 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	SPSB2	Q99619	263 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	TRIM4	Q9C037	500 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	THEG	Q9P2T0	379 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	MED16	Q9Y2X0	877 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ZNF711	Q9Y462	761 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	COL4A6	Q14031	1691 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	GBF1	Q92538	1859 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	GFRA2	O00451	464 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ECI2	O75521	394 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	TBX18	O95935	607 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	CHEK2	O96017	543 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ESR1	P03372	595 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	GALT	P07902	379 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	FSHR	P23945	695 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	SLC6A4	P31645	630 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	PTGER3	P43115	390 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ID4	P47928	161 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	TUBA4A	P68366	448 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	IKBKE	Q14164	716 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	INPP5A	Q14642	412 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68	5e-9	■■■■□ 20.6
RALGAPB-204	ENST00000438490	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	TPGS2	Q68CL5	300 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	VHLL	Q6RSH7	139 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	DHFR2	Q86XF0	187 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	MIB1	Q86YT6	1006 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	GPR65	Q8IYL9	337 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	HM13	Q8TCT9	377 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	NAT14	Q8WUY8	206 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	KCNJ9	Q92806	393 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	LRCH3	Q96II8	777 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	MARK4	Q96L34	752 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	GCNA	Q96QF7	691 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	HAUS8	Q9BT25	410 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	RNF112	Q9ULX5	631 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ARL5A	Q9Y689	179 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490		A0A0J9YYE9	177 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490		A0A1W2PP18	115 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	OR51F1	A6NGY5	319 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490		H3BMM5	538 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	UBXN8	O00124	270 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	EED	O75530	441 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ARHGEF15	O94989	841 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ESRRB	O95718	433 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	GFAP	P14136	432 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ATF6	P18850	670 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	IL2	P60568	153 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	LSAMP	Q13449	338 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	IL23R	Q5VWK5	629 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	PIM3	Q86V86	326 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	DPP10	Q8N608	796 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	OR7D4	Q8NG98	312 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	C3orf30	Q96M34	536 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	P2RY12	Q9H244	342 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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