RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436996.1

TTC28-AS1-215, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ITGA9Q13797 1035 aa9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF789Q5FWF6 425 aa9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LDLRAP1Q5SW96 308 aa9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HES3Q5TGS1 186 aa9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TMEM220Q6QAJ8 160 aa9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AFTPHQ6ULP2 937 aa9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TAS2R42Q7RTR8 314 aa9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PPIL6Q8IXY8 311 aa9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CLDN19Q8N6F1 224 aa9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FAM181AQ8N9Y4 354 aa9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC37A2Q8TED4 501 aa9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SGF29Q96ES7 293 aa9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DPEP2Q9H4A9 486 aa9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TRIM39Q9HCM9 518 aa9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SOX13Q9UN79 622 aa9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 WDR37Q9Y2I8 494 aa9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SNX24Q9Y343 169 aa9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MRFAP1Q9Y605 127 aa9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 EPG5Q9HCE0 2579 aa9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 A0A1W2PQM1 296 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ESYT3A0FGR9 886 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NEMP2A6NFY4 417 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OR52A4PA6NMU1 304 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CCDC188H7C350 402 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TPP1O14773 563 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PPFIA2O75334 1257 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ITGB6P18564 788 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MSH3P20585 1137 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RPL10P27635 214 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CSF2RBP32927 897 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HADHAP40939 763 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PAFAH1B1P43034 410 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ABCG1P45844 678 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PREPP48147 710 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CACNG1Q06432 222 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GTF2H3Q13889 308 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C14orf28Q4W4Y0 310 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PCID2Q5JVF3 399 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CASC4Q6P4E1 433 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C4orf22Q6V702 233 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MCUQ8NE86 351 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OR6P1Q8NGX9 317 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LRRC45Q96CN5 670 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SIGLEC10Q96LC7 697 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RMDN2Q96LZ7 410 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CCDC3Q9BQI4 270 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TIMM29Q9BSF4 260 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DUSP23Q9BVJ7 150 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KIFC1Q9BW19 673 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SCNM1Q9BWG6 230 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IL22Q9GZX6 179 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GRHL1Q9NZI5 618 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TMEM9Q9P0T7 183 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CDC23Q9UJX2 597 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 APPL1Q9UKG1 709 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PADI4Q9UM07 663 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PSMD13Q9UNM6 376 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CHMP2BQ9UQN3 213 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PCM1Q15154 2024 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IQCF5A8MTL0 148 aa9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 EFCAB8A8MWE9 144 aa9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KMOO15229 486 aa9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PPM1DO15297 605 aa9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 VEGFDO43915 354 aa9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 POP7O75817 140 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PRLHRP49683 370 aa9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OR1D5P58170 312 aa9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PRAMEP78395 509 aa9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CCL7P80098 99 aa9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MPP1Q00013 466 aa9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC7A5Q01650 507 aa9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CLCA4Q14CN2 919 aa9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms