RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430617.6

ATG4B-212, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 3

Gene ATG4B, Length 623 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-212ENST00000430617 MATN3O15232 486 aa10□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 METTL18O95568 372 aa10□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 MPSTP25325 297 aa10□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 CD68P34810 354 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 ITGA8P53708 1063 aa10□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 IL10RBQ08334 325 aa10□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 SEMA5AQ13591 1074 aa10□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 KCNJ11Q14654 390 aa10□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 C14orf28Q4W4Y0 310 aa10□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa10□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa10□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa10□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 C4orf22Q6V702 233 aa10□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 TEX26Q8N6G2 289 aa10□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 CNTD1Q8N815 330 aa10□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 BMPERQ8N8U9 685 aa10□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 NAT8LQ8N9F0 302 aa10□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 DCAF4L2Q8NA75 395 aa10□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 FBXO25Q8TCJ0 367 aa10□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.816e-11■■■■■ 51.9
ATG4B-212ENST00000430617 CPT1BQ92523 772 aa10□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 PPP1R16AQ96I34 528 aa10□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 VAT1Q99536 393 aa10□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 CTRCQ99895 268 aa10□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 TRIM55Q9BYV6 548 aa10□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 CEP41Q9BYV8 373 aa10□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 GBA3Q9H227 469 aa10□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 LUZP4Q9P127 313 aa10□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 VPS51Q9UID3 782 aa10□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa10□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 NFU1Q9UMS0 254 aa10□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 B4DGG1 531 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 TSPAN6O43657 245 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 RFPL1O75677 317 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 ZMPSTE24O75844 475 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 STK10O94804 968 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 RASGRP1O95267 797 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 HLA-DQB2P05538 268 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 ITIH2P19823 946 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 PSMB4P28070 264 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 CD1CP29017 333 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 ALDH4A1P30038 563 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 ETFBP38117 255 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 ADCY8P40145 1251 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 BLKP51451 505 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 LIMK2P53671 638 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 ARF5P84085 180 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 MC1RQ01726 317 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 CALCOCO2Q13137 446 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 ERV3-1Q14264 604 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 MORF4L2Q15014 288 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 TEX44Q53QW1 395 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 DCAF12Q5T6F0 453 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 TMCO4Q5TGY1 634 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 ANKRD22Q5VYY1 191 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 C22orf39Q6P5X5 142 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 ENPP7Q6UWV6 458 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 HOOK3Q86VS8 718 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 NRSN1Q8IZ57 195 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 BBOF1Q8ND07 529 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 AGBL5Q8NDL9 886 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 FAM46DQ8NEK8 389 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 IFT81Q8WYA0 676 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 CAVIN3Q969G5 261 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 VOPP1Q96AW1 172 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 LRRC45Q96CN5 670 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 RNF31Q96EP0 1072 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 PDXPQ96GD0 296 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 TEKT5Q96M29 485 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 C5orf34Q96MH7 638 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 ZNF599Q96NL3 588 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 FMO2Q99518 471 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 SP110Q9HB58 689 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 ATP13A1Q9HD20 1204 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 TMEM9Q9P0T7 183 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 TRHDEQ9UKU6 1024 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 SLC5A6Q9Y289 635 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 MYO7BQ6PIF6 2116 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 NDC80O14777 642 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 KDELR3O43731 214 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 MMP20O60882 483 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 CD160O95971 181 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 FAM153BP0C7A2 387 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 CCNB1P14635 433 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 NFKB1P19838 968 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 TPSB2P20231 275 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 GKP32189 559 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-212ENST00000430617 CSF2RBP32927 897 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms