RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417088.2

RPS28-201, Transcript of ribosomal protein S28, humanhuman

TSL 2

Gene RPS28, Length 334 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28-201ENST00000417088 RELNP78509 3460 aa14.56□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 AKR1B10O60218 316 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 KIAA0754O94854 1291 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 NDUFA10O95299 355 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 FGF5P12034 268 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 PTPN3P26045 913 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 CD68P34810 354 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 HMGCLP35914 325 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 DLSTP36957 453 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 CAPZBP47756 277 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 NOMO1Q15155 1222 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 CACHD1Q5VU97 1274 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 CXorf40BQ96DE9 158 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 ZDHHC12Q96GR4 267 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 ELMO2Q96JJ3 720 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 TEKT5Q96M29 485 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 CHP1Q99653 195 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 IL26Q9NPH9 171 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 SPTLC3Q9NUV7 552 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 EPHA6Q9UF33 1036 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 KCTD3Q9Y597 815 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 KCNMB2Q9Y691 235 aa14.55□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 SPAG6O75602 509 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 FURINP09958 794 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 VCLP18206 1134 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 WASHC5Q12768 1159 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 SEPT6Q14141 434 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 ERV3-1Q14264 604 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 KDELC1Q6UW63 502 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 MFSD7Q6UXD7 560 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 FAM92BQ6ZTR7 304 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 RASGRP3Q8IV61 690 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 RHOT2Q8IXI1 618 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 TTC30BQ8N4P2 665 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 GDAP1Q8TB36 358 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 BRSK1Q8TDC3 778 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 RAB33BQ9H082 229 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 FAM153AQ9UHL3 310 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 HYOU1Q9Y4L1 999 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa14.54□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 UGT1A9O60656 530 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 KCNJ13O60928 360 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 KATNA1O75449 491 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 TPM3P06753 285 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 TNNT1P13805 278 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 NELFEP18615 380 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 UGT1A6P19224 532 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 NFKB1P19838 968 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 UGT1A1P22309 533 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 UGT1A4P22310 534 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 CA5AP35218 305 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 CHRNA4P43681 627 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 WNT3AP56704 352 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 PPP1CAP62136 330 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 GTF2H3Q13889 308 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 TRIM14Q14142 442 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 ODF2Q5BJF6 829 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 IRGCQ6NXR0 463 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 PPP1R3BQ86XI6 285 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 RHOT1Q8IXI2 618 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 DTX3LQ8TDB6 740 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 TTC25Q96NG3 672 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 TRABDQ9H4I3 376 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 UGT1A7Q9HAW7 530 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 UGT1A10Q9HAW8 530 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 UGT1A8Q9HAW9 530 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 IL17CQ9P0M4 197 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 SEMA5BQ9P283 1151 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
RPS28-201ENST00000417088 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS28-201ENST00000417088 K7EM74 188 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS28-201ENST00000417088 GPR39O43194 453 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS28-201ENST00000417088 POP7O75817 140 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
RPS28-201ENST00000417088 TIAF1O95411 115 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS28-201ENST00000417088 EPOP01588 193 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS28-201ENST00000417088 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
RPS28-201ENST00000417088 NR1D1P20393 614 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS28-201ENST00000417088 FECHP22830 423 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS28-201ENST00000417088 HALP42357 657 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS28-201ENST00000417088 CDKN2BP42772 138 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS28-201ENST00000417088 SLC1A1P43005 524 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS28-201ENST00000417088 NR2C2P49116 596 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS28-201ENST00000417088 CTSCP53634 463 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS28-201ENST00000417088 DMPKQ09013 629 aa14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms