RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410062.8

UBE2E3-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-202ENST00000410062 SPINK2P20155 84 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 PMLP29590 882 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 SEMA3AQ14563 771 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 AMZ2Q86W34 360 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 HEXDCQ8WVB3 486 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 NAT6Q93015 286 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 CCDC74AQ96AQ1 378 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 SNF8Q96H20 258 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 RABGEF1Q9UJ41 708 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 SNX24Q9Y343 169 aa23.47■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 CASC3O15234 703 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 GP1BAP07359 652 aa23.46■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 RPL21P46778 160 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 CLCNKAP51800 687 aa23.46■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 ITGA8P53708 1063 aa23.46■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 MORF4L2Q15014 288 aa23.46■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa23.46■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 MAATS1Q7Z4T9 603 aa23.46■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 ARL14Q8N4G2 192 aa23.46■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 CLDN19Q8N6F1 224 aa23.46■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 SGSM3Q96HU1 749 aa23.46■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 SIGLEC10Q96LC7 697 aa23.46■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 PWWP2AQ96N64 755 aa23.46■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa23.46■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 RNF215Q9Y6U7 377 aa23.46■■□□□ 1.35
UBE2E3-202ENST00000410062 A6NCN8 305 aa23.45■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM187AA6NFU0 413 aa23.45■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 PRR19A6NJB7 356 aa23.45■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 BANF1O75531 89 aa23.45■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 VAPBO95292 243 aa23.45■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 GLB1P16278 677 aa23.45■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 VCLP18206 1134 aa23.45■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 ARNTP27540 789 aa23.45■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 BCL7AQ4VC05 210 aa23.45■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 CCDC3Q9BQI4 270 aa23.45■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 CATSPERZQ9NTU4 200 aa23.45■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 LRIT1Q9P2V4 623 aa23.45■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 WASF3Q9UPY6 502 aa23.45■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 PTPRBP23467 1997 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 MAGEB16A2A368 324 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 CDK4P11802 303 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 F3P13726 295 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 RPL10P27635 214 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 DRG2P55039 364 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 E2F1Q01094 437 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 MSS51Q4VC12 460 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 OR6C4Q8NGE1 309 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 KIF18AQ8NI77 898 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 MAPK15Q8TD08 544 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC37A2Q8TED4 501 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 ERP44Q9BS26 406 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 ABCG4Q9H172 646 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 DPH5Q9H2P9 285 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM8A1Q9UBU6 413 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 ANAPC5Q9UJX4 755 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 MRFAP1Q9Y605 127 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 PRSS21Q9Y6M0 314 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 PDZK1P1A8MUH7 402 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 GOLGA8KD6RF30 607 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 GOLGA8TH3BQL2 631 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 TP73O15350 636 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 OPA1O60313 960 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 OR1I1O60431 355 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 PRLHRP49683 370 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 NFE2L1Q14494 772 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 ITIH4Q14624 930 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 ARMC3Q5W041 872 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 IYDQ6PHW0 289 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 CERS6Q6ZMG9 384 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 SFRP1Q8N474 314 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 SCNM1Q9BWG6 230 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa23.44■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 IDSP22304 550 aa23.43■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 NSG1P42857 185 aa23.43■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 DMPKQ09013 629 aa23.43■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 BIRC2Q13490 618 aa23.43■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 HES3Q5TGS1 186 aa23.43■■□□□ 1.34
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