RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 GRPEL2Q8TAA5 225 aa21.54■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 LPIN3Q9BQK8 851 aa21.54■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 MID1IP1Q9NPA3 183 aa21.54■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 FAM72CH0Y354 149 aa21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 USP2O75604 605 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 CST1P01037 141 aa21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 LINC00032P0C843 101 aa21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 ALOX12P18054 663 aa21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 CASP2P42575 452 aa21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 IL5RAQ01344 420 aa21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 GRIK2Q13002 908 aa21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 TPRG1LQ5T0D9 272 aa21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 FAM72AQ5TYM5 149 aa21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 IL31Q6EBC2 164 aa21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 FAAH2Q6GMR7 532 aa21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 FAM72DQ6L9T8 149 aa21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 ISCA2Q86U28 154 aa21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 FAM72BQ86X60 149 aa21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 HID1Q8IV36 788 aa21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 HSFY1Q96LI6 401 aa21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 ASB7Q9H672 318 aa21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 TPRKBQ9Y3C4 175 aa21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 ANKRD12Q6UB98 2062 aa21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 TEX28O15482 410 aa21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 HS6ST1O60243 411 aa21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 MT-ND2P03891 347 aa21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 NPR1P16066 1061 aa21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 NKG7Q16617 165 aa21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 NXNL2Q5VZ03 156 aa21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 LAIR1Q6GTX8 287 aa21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 SPESP1Q6UW49 350 aa21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 SYTL1Q8IYJ3 562 aa21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 ASB2Q96Q27 587 aa21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 KCNA7Q96RP8 456 aa21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 VAT1Q99536 393 aa21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 COMMD8Q9NX08 183 aa21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 BCKDKO14874 412 aa21.52■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 GOT2P00505 430 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 FMO3P31513 532 aa21.52■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 RBP5P82980 135 aa21.52■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 MVKQ03426 396 aa21.52■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 LAPTM5Q13571 262 aa21.52■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 SLC10A6Q3KNW5 377 aa21.52■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 LYPD8Q6UX82 237 aa21.52■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa21.52■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.52■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 SMPD4Q9NXE4 827 aa21.52■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 ITM2BQ9Y287 266 aa21.52■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 SEMA3DO95025 777 aa21.52■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 SNX4O95219 450 aa21.52■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 FADS2O95864 444 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 APOA1P02647 267 aa21.52■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 CYBBP04839 570 aa21.52■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 CYP11A1P05108 521 aa21.52■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 M6PRP20645 277 aa21.52■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 RRM2P31350 389 aa21.52■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 DEFA1P59665 94 aa21.52■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 DEFA3P59666 94 aa21.52■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 BNIPLQ7Z465 357 aa21.52■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 NATD1Q8N6N6 113 aa21.52■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 PSD4Q8NDX1 1056 aa21.52■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 DPF3Q92784 378 aa21.52■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 TREX1Q9NSU2 369 aa21.52■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 AIG1Q9NVV5 245 aa21.52■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa21.52■■□□□ 1.04
OPN3-201ENST00000366554 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa21.51■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 NPPAP01160 153 aa21.51■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 JCHAINP01591 159 aa21.51■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 GGT1P19440 569 aa21.51■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 PRKACGP22612 351 aa21.51■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 STAT5BP51692 787 aa21.51■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 UFM1P61960 85 aa21.51■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 ARHGEF6Q15052 776 aa21.51■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 YIF1BQ5BJH7 314 aa21.51■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 OTOP3Q7RTS5 596 aa21.51■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 TTC9Q92623 222 aa21.51■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 ITCHQ96J02 903 aa21.51■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 UGT2B28Q9BY64 529 aa21.51■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 COX16Q9P0S2 106 aa21.51■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 MOSPD1Q9UJG1 213 aa21.51■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 BTRCQ9Y297 605 aa21.51■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 PRR35P0CG20 571 aa21.51■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 CXCR4P61073 352 aa21.51■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 MFSD10Q14728 455 aa21.51■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 CDONQ4KMG0 1287 aa21.51■■□□□ 1.03
OPN3-201ENST00000366554 Q5BKY6 102 aa21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms