RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 RAB6BQ9NRW1 208 aa21.71■■□□□ 1.07
PITX1-201ENST00000265340 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
PITX1-201ENST00000265340 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa21.71■■□□□ 1.07
PITX1-201ENST00000265340 ZNF639Q9UID6 485 aa21.71■■□□□ 1.07
PITX1-201ENST00000265340 USP18Q9UMW8 372 aa21.71■■□□□ 1.07
PITX1-201ENST00000265340 AGAP5A6NIR3 686 aa21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 H0Y858 1186 aa21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 KRT7P08729 469 aa21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 CTSHP09668 335 aa21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 PCMT1P22061 227 aa21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 FMO4P31512 558 aa21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 ACLYP53396 1101 aa21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 NKX3-2P78367 333 aa21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 HADHQ16836 314 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 FAM45BPQ6NSW5 357 aa21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 KIAA1958Q8N8K9 716 aa21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 FAM45AQ8TCE6 357 aa21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 PAK5Q9P286 719 aa21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 PCP4L1A6NKN8 68 aa21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 KPNA6O60684 536 aa21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 SEMA3DO95025 777 aa21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 PDGFRAP16234 1089 aa21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 GPD1P21695 349 aa21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 CST5P28325 142 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 MAGEA6P43360 314 aa21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 ROR1Q01973 937 aa21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 CDO1Q16878 200 aa21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 HACD2Q6Y1H2 254 aa21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 ZNF767PQ75MW2 155 aa21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 STRADAQ7RTN6 431 aa21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 TRPV3Q8NET8 790 aa21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 SERHL2Q9H4I8 314 aa21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 TLR9Q9NR96 1032 aa21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 ATP6V1HQ9UI12 483 aa21.7■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 UQCRC1P31930 480 aa21.69■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa21.69■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 TAF2Q6P1X5 1199 aa21.69■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 UNC93AQ86WB7 457 aa21.69■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 MCFD2Q8NI22 146 aa21.69■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 KIFC1Q9BW19 673 aa21.69■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 DTLQ9NZJ0 730 aa21.69■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 ACTR3BQ9P1U1 418 aa21.69■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 OSGIN1Q9UJX0 560 aa21.69■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 G3V2L1 256 aa21.69■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 TPST1O60507 370 aa21.69■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 SRP72O76094 671 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 IL7P13232 177 aa21.69■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 MAGEA3P43357 314 aa21.69■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 VBP1P61758 197 aa21.69■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 RHAGQ02094 409 aa21.69■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 MCUQ8NE86 351 aa21.69■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 CLEC4CQ8WTT0 213 aa21.69■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 SIGLEC10Q96LC7 697 aa21.69■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 CNPY3Q9BT09 278 aa21.69■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 MMP27Q9H306 513 aa21.69■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 CCSER2Q9H7U1 834 aa21.69■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 WDR70Q9NW82 654 aa21.69■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 PDE10AQ9Y233 779 aa21.69■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 HMX3A6NHT5 357 aa21.68■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 H3BMM5 538 aa21.68■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 TFEBP19484 476 aa21.68■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 ADORA2BP29275 332 aa21.68■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 CD68P34810 354 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 PRIM2P49643 509 aa21.68■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 TBRG1Q3YBR2 411 aa21.68■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 COLEC12Q5KU26 742 aa21.68■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 FERD3LQ96RJ6 166 aa21.68■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 ASNSD1Q9NWL6 643 aa21.68■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 MAGP20916 626 aa21.68■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 GARSP41250 739 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 LILRA4P59901 499 aa21.68■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 ZNF45Q02386 682 aa21.68■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 ARHGAP17Q68EM7 881 aa21.68■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 KCTD6Q8NC69 237 aa21.68■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 ZFP14Q9HCL3 533 aa21.68■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa21.68■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 CCDC78A2IDD5 438 aa21.67■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 CHRNGP07510 517 aa21.67■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 RFC2P35250 354 aa21.67■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 TAF6P49848 677 aa21.67■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 PRKAA1Q13131 559 aa21.67■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 ACOX1Q15067 660 aa21.67■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 PPM1JQ5JR12 505 aa21.67■■□□□ 1.06
PITX1-201ENST00000265340 LIMS2Q7Z4I7 341 aa21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms